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求助VASP静电势数值与Multiwfn计算数值相反

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发布时间: 2020-12-1 16:45

正文摘要:

请教各位前辈,我用Multiwfn和VASP分别计算了蒽醌分子的静电势,并截取了一个平行分子平面的截面观察对比(VASP计算结果用VESTA显示),发现二者做出来的图像颜色相反。我知道国外有些软件默认颜色是小值红,大值蓝 ...

回复 Reply

张凤翔 发表于 Post on 2021-10-26 08:39:58
你好,能详细说一下这个问题怎么解决的吗
卡开发发 发表于 Post on 2020-12-7 14:40:31
jitou11 发表于 2020-12-7 10:32
手册中只提到了这个:

按我理解应该是选择一个合适的参考原子(比如化学环境不变),然后以这个原子的值对两个体系进行参考。
卡开发发 发表于 Post on 2020-12-7 10:20:13
jitou11 发表于 2020-12-7 10:18
这个可能是在OUTCAR中,搜索average (electrostatic) potential at core可得

我想知道得到它以后如何 ...

手册有提到。
卡开发发 发表于 Post on 2020-12-3 11:06:35
jitou11 发表于 2020-12-3 10:55
我感觉手册这里说的特别含糊。我问一下average electrostatic potential at each ion如何得到?这个感觉 ...

按手册的意思应该是LVTOT或LVHAR会打出来,我没做过测试,你可以试一下,实在不行再看代码本身的情况。
卡开发发 发表于 Post on 2020-12-3 10:31:30
jitou11 发表于 2020-12-3 10:06
卡老师,我有个疑问。LVHAR是不是对电子(密度)的静电势?如果要换成常用的,以一单位正电荷作为试探电 ...

不排除这样的可能,但VASP不是我常用的程序,要确定的话最好去官方论坛或者看源码确定。
granvia 发表于 Post on 2020-12-2 14:06:57
很简单,测试一下HF分子,看看哪个算得对
卡开发发 发表于 Post on 2020-12-2 09:32:44
lonelycvavc 发表于 2020-12-2 09:21
谢谢前辈指点!平面波方法计算静电势能级会发生平移,想要比较不同体系之间的静电势可以用average electr ...

那看来不是巧合,具体绘制或处理的时候我不确定是怎样的。
lonelycvavc 发表于 Post on 2020-12-2 09:21:54
卡开发发 发表于 2020-12-2 09:06
LVHAR就是计算静电势的(不包含Vxc),区别是平面波计算方法在处理静电作用的时候会扔掉G=0的部分,导致 ...

谢谢前辈指点!平面波方法计算静电势能级会发生平移,想要比较不同体系之间的静电势可以用average electrostatic potential先对齐能级位置再比较,这个我有点明白了。那您看我算出来LVHAR的图像结果和Multiwfn计算恰好相反是我算错了吗?感觉应该不是巧合,我也算了几个其他体系,结果都是一样的,图像形状几乎相同但是颜色相反。
卡开发发 发表于 Post on 2020-12-2 09:06:28
lonelycvavc 发表于 2020-12-2 08:45
谢谢!我采用的是LVHAR,LVTOT做出的图像和Multiwfn相去甚远,但LVHAR的结果和Multiwfn的静电势几乎完全 ...

LVHAR就是计算静电势的(不包含Vxc),区别是平面波计算方法在处理静电作用的时候会扔掉G=0的部分,导致能级都会发生一个平移,所以算出来静电势的绝对值不具备参考意义(通常表面系统我们可以参考远离表面的区域作为能量0点来确定静电势的相对值)。当然,你上面提到的average electrostatic potential也可以用来对齐不同体系的能级位置进行比较。
lonelycvavc 发表于 Post on 2020-12-2 08:45:03
卡开发发 发表于 2020-12-1 23:41
average electrostatic potential不是做这个用的,而是对标能级的时候才用得到。
我不确定你是否采用的 ...

谢谢!我采用的是LVHAR,LVTOT做出的图像和Multiwfn相去甚远,但LVHAR的结果和Multiwfn的静电势几乎完全相同(除了颜色)。请问LVHAR是否可以用来计算周期性体系的静电势呢?以及为什么它好像和静电势数值正好相反呢?
卡开发发 发表于 Post on 2020-12-1 23:41:26
lonelycvavc 发表于 2020-12-1 17:48
感谢社长。VASP手册中将这个式子称为“the average electrostatic potential at each ion”,全文如下:V ...

average electrostatic potential不是做这个用的,而是对标能级的时候才用得到。
我不确定你是否采用的是LVHAR而不是LVTOT,后者会把Vxc计入进来。
lonelycvavc 发表于 Post on 2020-12-1 17:48:37
sobereva 发表于 2020-12-1 17:25
静电势的定义就一种。Multiwfn用的是最标准的静电势的定义

静电势的定义不可能是你最后一张图的样子,那 ...

感谢社长。VASP手册中将这个式子称为“the average electrostatic potential at each ion”,全文如下:VASP also calculates the average electrostatic potential at each ion. This is done, by placing a test charge with the norm
1, at each ion and calculating然后给出了帖中的式子。
我也认为氧附近的静电势不可能为正值,但从图像来看,两个计算的结果非常相似,几乎就是颜色反了一下,那么VASP给出的结果我能不能添加负号直接使用呢?
sobereva 发表于 Post on 2020-12-1 17:25:17
静电势的定义就一种。Multiwfn用的是最标准的静电势的定义

静电势的定义不可能是你最后一张图的样子,那都不是函数了,而是个标量

氧附近的静电势明显不可能是正值,正值说明算错了。

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