夏一天 发表于 2021-8-16 18:30 把DSSP 配置到环境变量里就行了,不配置没法用 |
| 兄弟,我情况和你一样,win版的gromac不出结果,显示也和你的一样,请问如何解决的?感谢! |
计算小菜鸡 发表于 2021-4-2 16:24 我装的win版的groamcs,跟DSSP,然后配置下环境变量,就可以用啦 |
好孩纸呀 发表于 2021-3-31 22:24 麻烦说一下,怎么做的,dssp我无法安装 |
计算小菜鸡 发表于 2021-3-31 10:25 windows 下的啊 |
好孩纸呀 发表于 2021-3-28 19:54 请问一下,你是怎么弄好的,windows还是linux,谢谢 |
Acee 发表于 2021-1-31 19:10 我弄好了 ,谢谢您呀 |
如此看来应该是,你gromacs版本太高,在Linux系统下按照sob老师的教程安装2018.4版本的gromacs,再按照这个博文的内容安装dssp(http://bbs.keinsci.com/thread-14384-1-1.html)。即可使用dssp,亲测可用。![]() |
sobereva 发表于 2020-12-6 14:25 谢谢老师 |
好孩纸呀 发表于 2020-12-5 22:11 自己电脑装个vmware虚拟机跑linux就完了,简单至极 VMware 15中安装CentOS 7.6 Linux系统的过程演示 https://www.bilibili.com/video/av39555524/ GROMACS 2018.4在CentOS 7.6下的安装过程演示 https://www.bilibili.com/video/av39749252/ |
sobereva 发表于 2020-12-5 22:05 老师,我们是租的服务器,公共文件夹不让放dssp,您说的VMD的timeline我用过,这里我用dssp是想得到ssdump.dat,然后用awk_ss.bsh脚本统计二级结构的概率来作图,搞了一天了,愁死我啦 |
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用linux就完了 或者用VMD的timeline插件代替,更方便 |
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