蒙面男子 发表于 2020-12-11 09:14
它是二维材料，而且中间是个苯环，手动加H原子就会出现两个。调到中间以后两个合在一起了，计算的时候没 ...

应该把多余的氢删掉，然后把剩下的那个氢调成和苯环共面。
另外左右两个大共轭环也要加氢

蒙面男子 发表于 2020-12-9 20:17
但是文献里面没给H原子坐标，手动加就会出错

出什么错？把具体报错信息贴上来。
每个原子上的氢原子数都要符合化学常识，缺一个、多一个都不行。如果加的时候报错，意味着你加的方法错了，不意味着不该加，不能因此就跳过加氢的步骤。

wzkchem5 发表于 2020-12-9 10:36
必须加H原子。加了H原子之后再算，然后再谈别的。

但是文献里面没给H原子坐标，手动加就会出错

Penson 发表于 2020-12-9 13:07
什么都没说清楚，文献也没给，你的详细结构文件也没有，怎么分析？

文献已上传，不好意思哈

什么都没说清楚，文献也没给，你的详细结构文件也没有，怎么分析？

必须加H原子。加了H原子之后再算，然后再谈别的。