robustljb 发表于 2025-10-14 10:33
好的，谢谢您的回复。也就是说ORCA做从头算动力学(AIMD)计算时考虑隐式溶剂化效应，在原理上是没有问题的 ...

没问题。应当说任何既支持AIMD，又支持隐式溶剂化结构优化的软件，几乎必然可以做带隐式溶剂的AIMD

wzkchem5 发表于 2025-10-14 10:19
如果已知溶剂模型的非静电项确实很重要，那么可以。否则用CPCM更好，数值更稳定

好的，谢谢您的回复。也就是说ORCA做从头算动力学(AIMD)计算时考虑隐式溶剂化效应，在原理上是没有问题的吧

robustljb 发表于 2025-10-14 08:23
请教老师一个问题：使用ORCA做从头算动力学(AIMD)的时候，能否使用SMD模型来考虑隐式溶剂化效应。这样的计 ...

如果已知溶剂模型的非静电项确实很重要，那么可以。否则用CPCM更好，数值更稳定

请教老师一个问题：使用ORCA做从头算动力学(AIMD)的时候，能否使用SMD模型来考虑隐式溶剂化效应。这样的计算是否合理呢？

sobereva 发表于 2025-6-27 06:46
让目标温度低于参考温度就行了

明白了，那要分成几个文件，分别升温降温来做。

wilely 发表于 2025-6-26 18:41
能够做升温，降温过程吗？怎么设置？

让目标温度低于参考温度就行了

能够做升温，降温过程吗？怎么设置？

qaqfdmmj 发表于 2024-7-10 21:08
老师您好，我是根据您的帖子进行了类似工作的计算（仅将B97-3c换成了r2SCAN-3c），但是orca在输出每一步的 ...

没事甭用r2SCAN-3c跑动力学，比B97-3c没明显额外好处还白多花时间

老师您好，我是根据您的帖子进行了类似工作的计算（仅将B97-3c换成了r2SCAN-3c），但是orca在输出每一步的时候都会有If you are NOT using ECPs, check your basis set inputs!和NOTIFICATION: Different basis set in ORCA and otool_gcp: ORCA: 619  gCP: 617的提示，请问这是为什么，是基组不适合我的体系吗？

sobereva 发表于 2023-8-28 20:02
容易发生的反应，随便放得不离谱就能发生。对于难发生的反应，各种相对位置和朝向、相对初速度都考虑。如 ...

谢谢sob老师，我手头是正好有过渡态的结构。

开心の土豆雷 发表于 2023-8-28 19:53
在调研AIMD的流程时，注意到初始结构的是一个非常关键的点。怎样根据自己的需要选择有意义的初始结构呢？ ...

容易发生的反应，随便放得不离谱就能发生。对于难发生的反应，各种相对位置和朝向、相对初速度都考虑。如果有静态计算得到的过渡态，可以参考着去摆

sobereva 发表于 2023-8-28 15:52
放不远不近就完了

在调研AIMD的流程时，注意到初始结构的是一个非常关键的点。怎样根据自己的需要选择有意义的初始结构呢？
比如说我就想看一下两个不同分子之间能否发生反应以及怎样反应。从不同的初始结构开始跑AIMD肯定有不同的结论，这时候我该怎么选择初始结构呢？

开心の土豆雷 发表于 2023-8-28 13:22
NH3分子的位置是怎么确定的？只要放在附近就会自动找到质子转移的轨迹嘛？

放不远不近就完了

NH3分子的位置是怎么确定的？只要放在附近就会自动找到质子转移的轨迹嘛？