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用MS建模之后。更改原子名称后,pdb文件报错

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发布时间: 2020-12-15 15:15

正文摘要:

在MS中画好分子之后,导入VMD可以直接观看(图1)。将其上传至ATB,得到优化的pdb及itp文件,在VMD中依然可以打开(图2).当我把MS中的原子类型改为ATB中的原子类型时,VMD文件就打不开了(图3).谢谢各位老师了。 ...

回复 Reply

随风 发表于 Post on 2020-12-15 20:29:52
Lacrimosa 发表于 2020-12-15 17:14
打开pdb把connect的字段删掉

谢谢老师了,我可能是原子类型不对。
随风 发表于 Post on 2020-12-15 20:29:07
Kangtor 发表于 2020-12-15 19:38
会不会是你改了原子类型时把格式弄错了?

对,就是我改原子类型弄错了,谢谢老师
Kangtor 发表于 Post on 2020-12-15 19:38:44
会不会是你改了原子类型时把格式弄错了?
Lacrimosa 发表于 Post on 2020-12-15 17:14:59
打开pdb把connect的字段删掉

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