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求助:计算的锌离子和小分子中的氧原子的rdf是否合理

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发布时间: 2020-12-16 08:16

正文摘要:

用gromacs算出的锌离子和小分子中的氧原子的rdf,可是第一个峰后面一直在往上变大,而不是一条平直的直线,合理吗?该怎么解释这个现象呢?

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sobereva 发表于 Post on 2020-12-16 10:18:09
本来GLU里的氧就不是均匀分布在体系中的(像溶剂中的氧那样),根据rdf的计算原理就知道没什么异常

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