让你变成回忆 发表于 2020-12-19 09:55
ONIOM在国内都快被玩坏了。
我之前见过有的输入文件，关键词部分没有UFF=QEq，在元素定义部分也没有指定 ...

确实如此，甚至连输入文件都不愿（敢）给人看。

sobereva 发表于 2020-12-19 09:46
估计不能
ONIOM的输出信息和一般情况有极为显著的不同，诸如chk里都没轨道波函数
就算用簇模型算固态，也 ...

ONIOM在国内都快被玩坏了。
我之前见过有的输入文件，关键词部分没有UFF=QEq，在元素定义部分也没有指定原子电荷。
感觉sob老师有必要专门写一个关于ONIOM的博文。

估计不能
ONIOM的输出信息和一般情况有极为显著的不同，诸如chk里都没轨道波函数
就算用簇模型算固态，也完全没必要用ONIOM，把周围区域原子用背景电荷表示就完事了。
而且你用QEq这种对静电势描述巨垃圾的电荷表现MM区域对QM区域的静电作用是完全不能接受的。另外，你都没写embedcharge，都没用电子嵌入，相当于周围部分对QM部分波函数根本都没起到极化效果。
你现在等于完全是瞎算。

估计ONIOM的输出pysoc是没法利用的。
可以考虑用charge替代MM部分，这样MM与QM的静电相互作用会考虑进去，实际上，对于算单点的目的，MM部分的范德华力不会对QM部分产生影响，所以利用charge背景电荷来替代MM是可以的。