zjxitcc 发表于 2021-8-23 10:55 谢谢您的建议,我会看看的! |
sobereva 发表于 2021-8-24 06:29 谢谢sobereva老师,我用最新的3.8版本计算成功了。以前是3.6的版本. 再次感谢您!谢谢! |
haibeih 发表于 2021-8-23 08:51 我用目前官网上最新版Multiwfn算你的体系没发现结果有任何问题
如果不是最新版先用最新版再试。如果你那里用最新版还是不出结果,把Multiwfn启动后输出的所有信息复制到文本文件里上传我看看。 |
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你这问题不一定要算回旋半径吧,可能波函数的<r^2>值就能体现出你要的结果。高斯单点计算的输出文件里就有,搜 Electronic spatial extent (au): <R**2> |
sobereva 发表于 2021-8-23 04:58 老师您好,fchk文件如下: https://pan.baidu.com/s/1Ht3RpGm5KxEF9Bp8egPTag 提取码:g0wx 麻烦您帮忙看一下,实际上这种小结构的计算一直不能得到回转半径,而其他稍微大一些的结构是可以成功的,所以我不知道计算回转半径是否和体系复杂程度有关,或者是我安装的Multiwfn出现错误。 谢谢您! |
| fchk压缩后上传,如果超过5MB,传网盘 |
haibeih 发表于 2021-8-21 10:42 完全是乱用关键词 density scfcyc=84048 通通去掉,仔细看 常见的多余的和被滥用的Gaussian关键词 http://sobereva.com/331(http://bbs.keinsci.com/thread-3460-1-1.html) 甭写毫无意义的NonEquilibrium=save 还有问题之后再说,先把关键词弄像话 |
sobereva 发表于 2020-12-24 14:22 老师您好,我最近尝试用Gaussian得到的fchk文件,在Multiwfn中计算电子自旋密度的Radius of gyration。 按照手册200.11下 3 // Select real space function 5 // Spin density 2 // Calculate center of spin density y // Take the resultant center as the one for evaluating the first and second moments 1 // Evaluate the first and second moments 的顺序输入。 但是计算 “2 // Calculate center of spin density“ 的时候却显示: The center of the function: X= NaN Y= NaN Z= NaN Angstrom 于是1//计算不出结果。手动指定center也不行。 我的结构非常简单,就是4个水分子包含一个电子: %chk=B3LYP-6-31G.chk %nprocshared=36 %mem=110GB #p B3LYP/6-311++G(d,p) density scfcyc=84048 SCRF(Read,NonEquilibrium=save) H2O -1 2 H 2.98830449 5.62223827 2.33601300 H 2.40557049 5.63954327 3.79999600 H 0.11752149 3.88720527 4.10528200 H -1.04117451 3.97109727 3.02427200 H 2.47704849 3.19800527 5.05255400 H 2.32920049 1.64806127 5.39000600 H 2.09896649 4.33563427 7.81198100 H 1.50720449 5.08163927 6.58030200 O 1.53391449 5.10797327 7.56970700 O 2.99695549 2.37337627 5.28636200 O 2.95369349 6.14891827 3.15913900 O -0.39411051 3.35525827 3.44486400 Eps=3.2 是不是我的结构太小了,还是settings.ini里面需要设置什么参数? 谢谢您! |
sobereva 发表于 2020-12-24 14:22 谢谢您!很有帮助! ![]() |
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Multiwfn(http://sobereva.com)的主功能200的子功能11就能算任意函数的回转半径。详见手册3.200.11节 如果你有Multiwfn可以认的波函数文件,诸如wfn、molden、fch等,建议以此作为输入文件让Multiwfn直接计算自旋密度,这样精度最好 如果只有cube文件,把Multiwfn的settings.ini设为-1(让用户自定义函数对应于cube文件插值得到的函数),然后用Multiwfn载入cube文件,进入上述功能,选择"3 Select the function to be studied"并选择100 User-defined function作为被计算的函数。然后选1开始计算。 注意如果cube文件对应非正交格子,Multiwfn目前版本在不支持用于以上功能 |
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