求助：gromacs是使用平底势能时效率问题

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发布时间: 2021-1-13 10:13

本帖最后由 1900 于 2021-1-13 10:17 编辑我使用平底势能后，并行使用40个核也非常的慢。平时用40个核一天能跑30多ns，现在基本上处于跑不动的状态，跟用一个核差不多。请问这是什么情况啊？多谢多谢

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sobereva 发表于 Post on 2021-1-15 06:12:26

碰到问题首先想到先用最新版本再试
5.1.5已经很老了

1900 发表于 Post on 2021-1-13 11:12:26

jimulation 发表于 2021-1-13 11:00
问题可能出在SIMD那行？可以试试编译时加上-DGMX_SIMD=AVX2_256试试

好的，我试试看，多谢多谢

jimulation 发表于 Post on 2021-1-13 11:00:57

问题可能出在SIMD那行？可以试试编译时加上-DGMX_SIMD=AVX2_256试试

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