使用文献中有机物分子参数求助

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发布时间: 2021-2-6 15:14

社长好，我想用一篇文献中的有机物分子的参数，有一些问题请教 1.他的力场形式如下图一。这个形式是CHARMM力场吗，文章说的是用charmm的原子类型。 2.我想在体系中利用Merz的离子参数加入离子，按照文章中这个势能 ...

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sobereva 发表于 Post on 2021-2-6 22:29:51

1 是
2 如果式子里没4π，那应该是等效体现在epsilon里了
3 手动加上
4 我对NAMD、CHARMM派系的东西不熟。NAMD网站上应该有力场参数文件格式的解释

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