使用文献中有机物分子参数求助

查看数: 10247 | 评论数: 1 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2021-2-6 15:14

社长好，我想用一篇文献中的有机物分子的参数，有一些问题请教 1.他的力场形式如下图一。这个形式是CHARMM力场吗，文章说的是用charmm的原子类型。 2.我想在体系中利用Merz的离子参数加入离子，按照文章中这个势能 ...

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2021-2-6 22:29:51

1 是
2 如果式子里没4π，那应该是等效体现在epsilon里了
3 手动加上
4 我对NAMD、CHARMM派系的东西不熟。NAMD网站上应该有力场参数文件格式的解释

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register