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Multiwfn做IGM分析时出现的H-H弱相互作用如何归属？

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qingmang

发布时间: 2021-2-7 18:38

正文摘要:

如题，我在使用Multiwfn对一个suzuki反应的过渡态进行可视化弱相互作用分析时，对苯甲醛基底物与甲氧基萘底物之间的弱相互作用利用IGM进行可视化时发现一个我认知外的弱相互作用，其为萘环上氢与醛基氢的吸引作用， ...

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sobereva 发表于 Post on 2021-2-8 20:51:35

qingmang 发表于 2021-2-8 09:43
我尝试了IGMH的方法，发现HH间仍然存在代表弱相互作用的等值面。我理解的IGMH的方法是使用初原子密度 ...

本来就肯定有对应H-H的等值面，毕竟都挨得这么近了，但至少IGMH不像IGM蓝得那么厉害而夸大了吸引作用强度。

PS：你的格点间距设得太大，图像太粗糙

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qingmang 发表于 Post on 2021-2-8 08:44:10

sobereva 发表于 2021-2-7 21:46
不是什么特殊的吸引作用，纯粹是因为当前其它部分的结构原因，导致两个氢恰好挨得比较近而已

另外，IGM ...

谢谢，我试试

sobereva 发表于 Post on 2021-2-7 21:46:13

不是什么特殊的吸引作用，纯粹是因为当前其它部分的结构原因，导致两个氢恰好挨得比较近而已

另外，IGM等值面比较肥，过于延伸到距离氢原子核比较近的位置，这部分区域电子密度又不是特别小，导致看上去颜色发蓝，会令你误以为有吸引作用。如果你改用我提出的IGMH，就不会有这个问题，IGMH的分析见Multiwfn手册4.20.11节

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