彤彤加油 发表于 2021-7-5 05:56
老师，有个现实问题，以OH-和另一反应物为高斯输入文件，以water作隐式溶剂，已经算完了。本来计划照您的 ...

除非OH-和反应物形成了若干根氢键，起到了类似显式溶剂水的效果，否则不靠谱

wzkchem5 发表于 2021-7-5 00:29
不应该固定

老师，有个现实问题，以OH-和另一反应物为高斯输入文件，以water作隐式溶剂，已经算完了。本来计划照您的建议加几个水分子试试，但是老板让投稿。想问下 之前计算的数据可以用吗？ 路径是合理的，只是没有考虑显式水。

wzkchem5 发表于 2021-7-5 00:29
不应该固定

谢谢

彤彤加油 发表于 2021-7-4 17:26
老师，再打扰问一下，如果放入水分子，找过渡态等计算时是否要固定水分子呢？

不应该固定

彤彤加油 发表于 2021-7-5 00:09
好的 谢谢

老师，再打扰问一下，如果放入水分子，找过渡态等计算时是否要固定水分子呢？

wzkchem5 发表于 2021-7-5 00:03
你查一下研究OH-(H2O)n团簇的文章，会告诉你放几个合适，以及应该怎么放。我不是完全确定

好的 谢谢

彤彤加油 发表于 2021-7-4 16:48
谢谢老师，那请问应该放几个水分子呢？有什么依据吗

你查一下研究OH-(H2O)n团簇的文章，会告诉你放几个合适，以及应该怎么放。我不是完全确定

wzkchem5 发表于 2021-6-24 18:46
对，你可以认为是因为隐式溶剂模型对于这种情况不够好，所以离OH-最近的水分子需要显式描述

谢谢老师，那请问应该放几个水分子呢？有什么依据吗

喵星大佬 发表于 2021-6-24 18:27
如果阴离子不直接参与反应，建议通过实验数据构造热力学循环来避免直接计算溶剂化阴离子

谢谢

彤彤加油 发表于 2021-6-24 11:19
请问 意思是 OH-作为反应物在隐式溶剂（水）条件下 ，找过渡态时也要放H2O分子吗？

对，你可以认为是因为隐式溶剂模型对于这种情况不够好，所以离OH-最近的水分子需要显式描述

如果阴离子不直接参与反应，建议通过实验数据构造热力学循环来避免直接计算溶剂化阴离子

wzkchem5 发表于 2021-2-10 23:00
对，像OH-(aq)这种和溶剂作用比较强的离子，计算时必须考虑第一配位层的水。
同理，反应物如果有和水形成 ...

请问 意思是 OH-作为反应物在隐式溶剂（水）条件下 ，找过渡态时也要放H2O分子吗？

wzkchem5 发表于 2021-2-10 23:00
对，像OH-(aq)这种和溶剂作用比较强的离子，计算时必须考虑第一配位层的水。
同理，反应物如果有和水形成 ...

谢谢指点！

对，像OH-(aq)这种和溶剂作用比较强的离子，计算时必须考虑第一配位层的水。
同理，反应物如果有和水形成强氢键，或与水配位的物种，计算时也要加几个水分子