计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

使用Multiwfn非常便利地创建CP2K程序的输入文件

查看数: 178449 | 评论数: 129 | 收藏 Add to favorites 57
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2021-2-22 22:25

正文摘要:

使用Multiwfn非常便利地创建CP2K程序的输入文件Using Multiwfn to very conveniently create input file of CP2K 文/Sobereva@北京科音First release: 2021-Feb-22  Last update: 2023-Nov-7 1 前言 ...

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2024-9-30 01:43:21
zhangtp 发表于 2024-9-29 20:41
卢老师,我想算亚铁磁尖晶石切面吸附N2O小分子的计算,以及搜索催化分解过渡态和反应动力学的计算,请问卢 ...

适合
zhangtp 发表于 Post on 2024-9-29 20:41:24
卢老师,我想算亚铁磁尖晶石切面吸附N2O小分子的计算,以及搜索催化分解过渡态和反应动力学的计算,请问卢老师这样子的计算适合用CP2K吗?我现在正在看看您的教程使用Multiwfn输入一些您提供的例子简单跑一跑cp2k,也看到明年三月可能会有cp2k的培训课,想参加学习一下。
sobereva 发表于 Post on 2024-8-1 01:22:56
wilely 发表于 2024-7-31 13:33
Vasp有哪些缺陷吗?我刚在自学

价格极贵。如果你不打算买它,学它没意义
而且算中、大体系速度也远远不及CP2K
wilely 发表于 Post on 2024-7-31 13:33:04
sobereva 发表于 2024-7-30 05:39
我反感VASP,不会做这种东西

Vasp有哪些缺陷吗?我刚在自学
sobereva 发表于 Post on 2024-7-30 05:39:18
wilely 发表于 2024-7-29 11:50
很好,能不能做个Vasp的输入文件,那就完美了。

我反感VASP,不会做这种东西
wilely 发表于 Post on 2024-7-29 11:50:58
很好,能不能做个Vasp的输入文件,那就完美了。
护卫天使 发表于 Post on 2024-3-30 22:12:56
老师好,我在学校平台的cp2k 7.1版本,GFN1-xTB方法跑了一个动力学模拟,可以正常跑,但是分子会随意乱飞(如图所示);于是,想添加一个外势WALL的关键词,但是遇到报错,附上输入输出文件。目前不知道怎么修改,输入文件可能会也含有错误,希望能得到老师的指导,十分感谢!

1711806986907.jpg (110.01 KB, 下载次数 Times of downloads: 35)

1711806986907.jpg

4.inp

99.15 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

cp2k.16911384.out

1.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

sobereva 发表于 Post on 2023-11-19 01:19:50
li_hx2001 发表于 2023-11-18 10:08
请问sob老师,旋轨耦合怎样设置?

没法考虑基态的旋轨耦合
如果是TDDFT算电子激发过程的旋轨耦合,Multiwfn创建CP2K输入文件的界面里开启TDDFT后屏幕上直接就能看到开启SOC的选项21 Toggle considering spin-orbit coupling effect in TDDFT(必须是Multiwfn较新的版本)
li_hx2001 发表于 Post on 2023-11-18 10:08:18
请问sob老师,旋轨耦合怎样设置?
sobereva 发表于 Post on 2023-11-9 06:00:53
naoki 发表于 2023-11-8 19:18
Sob老师我想请教一下您,对于含有Cu-卟啉结构的COF,在cp2k中使用何种泛函和基组做结构优化比较合适呢,谢 ...

通常这级别没问题

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +5 收起 理由
Reason
naoki + 5 谢谢

查看全部评分 View all ratings

naoki 发表于 Post on 2023-11-8 19:18:58
本帖最后由 naoki 于 2023-11-8 20:53 编辑

Sob老师我想请教一下您,对于含有Cu-卟啉结构的COF,在cp2k中使用何种泛函和基组做结构优化比较合适呢,谢啦
我目前使用PBE+DFT-D3(BJ)/DZVP-MOLOPT-SR-GTH不知对于结构优化是否够用
lx506173258 发表于 Post on 2023-11-2 08:29:49
ghifi37 发表于 2021-2-23 00:11
太好了,希望能代替好久没更新的pycp2k!

Multiwfn确实好用!
lx506173258 发表于 Post on 2023-11-2 08:25:16
感谢sobereva老师团队开发这么好用的工具,为我们小白带来了无限曙光!
sobereva 发表于 Post on 2023-3-12 10:13:02
牧生 发表于 2023-3-12 09:51
一直有个疑问,即使我懵懵懂懂的参加了培训,仍有一些不太清楚的地方,需要请教一下。
使用Multiwfn生成cp ...

课上说了,在CP2K里杂化泛函比纯泛函贵很多,所以纯泛函适合的情况下优先用纯泛函
基组用什么取决于具体目的。
课上举了各种体系的计算例子,虽然例子里用的级别不是唯一选择,但至少是合适的选择。
泛函不知道用什么就默认用PBE,也可以看他人的类似体系的研究文章看用的是什么。很多专门的问题的泛函选择问题在培训里“第一性原理计算的理论基础”部分都讲过。如果用全电子基组,选择方式和量化培训里说的一样,如果用CP2K的GTH赝势基组,CP2K培训班里“CP2K的基础知识”里讲基组的时候说过档次。
牧生 发表于 Post on 2023-3-12 09:51:19
一直有个疑问,即使我懵懵懂懂的参加了培训,仍有一些不太清楚的地方,需要请教一下。
使用Multiwfn生成cp2k的输入文件时,选项太多,各个理论方法和基组,或者它们的组合,适用的场景是怎么样的呢?比如有机小分子,选择这样的组合

1 Choose theoretical method, current: B3LYP
  2 Choose basis set and pseudopotential, current: Ahlrichs-def2-TZVP
  3 Set dispersion correction, current: DFT-D3(BJ)

感觉也很稀松平常,是不是有更好的选择呢?

而在http://sobereva.com/490文中,对orca使用的级别就介绍的非常清楚,反复看几遍就能恰当的选择自己平时所需的级别了。但现在用cp2k时,对方法的选择就有点无从下手,即使看了讲义,也并没有完全消化掉。。遇到和讲义上相似的体系,还可以抄抄作业,遇到不相似的,就有点不太会了。

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 04:24 , Processed in 0.184069 second(s), 27 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list