anlancx 发表于 2021-4-2 16:01
老师，高斯自带的PM7怎么使用呢？

直接写PM7

sobereva 发表于 2021-2-27 14:19
不要自己在标题里手写[求助]这种标签，此帖说了http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html，给你去掉了 ...

老师，高斯自带的PM7怎么使用呢？

wzkchem5 发表于 2021-2-27 14:33
这个不是内盐的问题，诸如氨基酸那样的也是内盐，但是可以算。这里主要还是在于这种特定的硼原子没有力场 ...

明白了，非常感谢！看的过程中正好有这样的疑惑，谢谢老师的耐心解答！

wzkchem5 发表于 2021-2-27 14:33
这个不是内盐的问题，诸如氨基酸那样的也是内盐，但是可以算。这里主要还是在于这种特定的硼原子没有力场 ...

确实，我就是想说这种B没有参数

Altair 发表于 2021-2-27 14:25
非常感谢“喵星大佬”老师的提示，我去看看内盐相关的内容

谢谢sob老师的提醒，标题方面我以后一定会注 ...

这个不是内盐的问题，诸如氨基酸那样的也是内盐，但是可以算。这里主要还是在于这种特定的硼原子没有力场参数。当然这样的硼原子没有力场参数也和它是内盐，所以不常见有关系，只是澄清一下不是所有的内盐都没有参数，内盐也不是决定是否有力场参数的重点

非常感谢“喵星大佬”老师的提示，我去看看内盐相关的内容

谢谢sob老师的提醒，标题方面我以后一定会注意的

谢谢sob老师的耐心解答！

不要自己在标题里手写[求助]这种标签，此帖说了http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html，给你去掉了。

绝对不要盲目用MMFF94预优化，否则只会自取其辱，很多情况都是定性错误的（诸如碗烯能优化成平面的，涉及到一些典型有机体系中不常见的基团也可靠性很差），甚至还不如一开始自己搭的结构合理，对于很多情况根本都没参数。这么点体系预优化明显不如用Gaussian自带的PM7，也不怎么花时间。

做MMFF94的分子动力学更是完全莫名其妙。考虑了热运动只会令得到的结构偏离平衡结构更远。

不懂基本原理就绝对不要瞎算，否则99%的几率是完全徒劳。

我不知道你是在什么论坛看到的什么帖子。如果是本论坛里看到的，那么帖子里用MMFF94优化一定是有合适的前提的。如果是其它论坛的，根本别轻易信。

这种内盐估计没有合适的力场参数，所以不能用力场预优化