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主族金属有机化合物的泛函如何选择?Gaussian程序中电荷能否指定到某个原子上?

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发布时间: 2021-3-2 13:38

正文摘要:

各位老师好!我主要有两个问题: 1.我在计算叔丁醇钠这种主族金属有机化合物的时候,泛函选择M06-2X(D3),结构优化6-31g**,单点def2-tzvp是否合适? 2.计算反应机理的时候,我可能需要单独计算叔丁醇负离 ...

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yaoyuan0711 发表于 Post on 2021-3-3 08:22:11
Accelerator 发表于 2021-3-2 17:46
几个概念问题:
1. 叔丁醇钠不属于金属有机化合物
2. 不知道你的溶剂是什么 大多数情况下醇盐都是以多聚 ...

抱歉是我弄错了。没有溶剂,直接跟丙酮反应生成酮烯
Accelerator 发表于 Post on 2021-3-2 17:46:19
几个概念问题:
1. 叔丁醇钠不属于金属有机化合物
2. 不知道你的溶剂是什么 大多数情况下醇盐都是以多聚体的形式参与反应的
yaoyuan0711 发表于 Post on 2021-3-2 16:58:01
sobereva 发表于 2021-3-2 15:13
仔细看看此文
谈谈约束性DFT(CDFT)
http://sobereva.com/271(http://bbs.keinsci.com/thread-535-1-1.ht ...

好的,非常感谢您!
sobereva 发表于 Post on 2021-3-2 15:13:53
仔细看看此文
谈谈约束性DFT(CDFT)
http://sobereva.com/271http://bbs.keinsci.com/thread-535-1-1.html

以及此文最后一节
谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态
http://sobereva.com/82

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yaoyuan0711 + 4 谢谢

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yaoyuan0711 发表于 Post on 2021-3-2 14:33:13
zjxitcc 发表于 2021-3-2 14:25
是的。你可以算完做布局分析,负电荷集中在叔丁醇上,尤其是叔丁醇氧上(不过,负电荷不可能像传统有机化 ...

好的,谢谢您了!
zjxitcc 发表于 Post on 2021-3-2 14:25:46
yaoyuan0711 发表于 2021-3-2 14:19
非常感谢您了,您说的非常全面。我还有一个问题不太确定,如果把叔丁醇负离子和一个丙酮分子放一起优化, ...

是的。你可以算完做布局分析,负电荷集中在叔丁醇上,尤其是叔丁醇氧上(不过,负电荷不可能像传统有机化学那样想象中是-1)
yaoyuan0711 发表于 Post on 2021-3-2 14:19:42
zjxitcc 发表于 2021-3-2 14:03
1. 可
2. “电荷能够直接加在氧原子上”这是受传统有机化学观念影响(du hai)的结果,只需保证整体电荷正 ...

非常感谢您了,您说的非常全面。我还有一个问题不太确定,如果把叔丁醇负离子和一个丙酮分子放一起优化,同样也是整体电荷为-1就可以了?
zjxitcc 发表于 Post on 2021-3-2 14:03:18
本帖最后由 zjxitcc 于 2021-3-2 14:06 编辑

1. 可
2. “电荷能够直接加在氧原子上”这是受传统有机化学观念影响(du hai)的结果,只需保证整体电荷正确即可。
3. 若阳离子被拿掉,体系含叔丁醇负离子,那你这整体是带负电的,需要用带弥散函数的基组。有两种方案:
(1)结构优化这步不加弥散,用例如6-31G(d,p),6-311G(d),6-311G(d,p)等,视体系大小和你的机器算力,能用多大基组就用多大基组。从你帖子有限的信息来看体系并不大,6-31G(d,p)略微有些寒碜。单点用弥散基组,如ma-def2-TZVP,def2-TZVPD, 6-311+G(d,p)等。
(2)结构优化和后续单点都用弥散基组,视体系大小和你的机器算力。
无论(1)或(2),加弥散都有两种方式:仅对涉及负离子的几个原子用带弥散的基组;对所有原子都用同一个带弥散的基组,视体系大小和你的机器算力。

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