xxzj 发表于 2023-1-7 21:39
老师，如果判断两个分子对是face-on堆积还是edge-on堆积，让d

标准跟具体体系有关
根据可视化程序里显示的实际结构，结合直觉定义判据。或者若有靠谱的文献里有讨论你研究的体系的几何特征，用别人定义的标准也可以

sobereva 发表于 2022-12-4 01:09
没什么必要算那个

老师，如果判断两个分子对是face-on堆积还是edge-on堆积，让d<5埃，ψ<45度为face-on这样定义可行吗？

xxzj 发表于 2022-12-3 19:07
谢谢老师，请问还有一个参数θ能否通过Multiwfn求得呢，是否有相关的帖子？辛苦老师啦

没什么必要算那个

sobereva 发表于 2022-11-25 01:54
平面间夹角是ψ，中心距离是d

谢谢老师，请问还有一个参数θ能否通过Multiwfn求得呢，是否有相关的帖子？辛苦老师啦

xxzj 发表于 2022-11-24 10:42
老师，您好，想请问我看了文献中的这张图，所对应的两个角度和距离是否就是您上面文章中所描述的错位角和 ...

平面间夹角是ψ，中心距离是d

sobereva 发表于 2022-3-3 15:38
操作方法相同，帧数输入1就完了

老师，您好，想请问我看了文献中的这张图，所对应的两个角度和距离是否就是您上面文章中所描述的错位角和平面间夹角及中心距离呢？辛苦老师~

xxzj 发表于 2022-3-3 08:49
老师，您好，我没有进行动力学模拟，想按照上述方式搭建界面的复合物中A和B两个分子间的距离和角度，应该如 ...

操作方法相同，帧数输入1就完了

老师，您好，我没有进行动力学模拟，想按照上述方式搭建界面的复合物中A和B两个分子间的距离和角度，应该如何进行操作?因为没有进行动力学模拟，所以输入帧数那列不知道应该选择什么，所以想向老师请教应该如何进行？

登登 发表于 2022-1-14 17:34
希望Multiwfn能提取更多xyz轨迹的信息，比如生成小分子量，反应元素溯源，反应路劲分析，，，虽然VMD和ovit ...

这个不属于Multiwfn的范畴

希望Multiwfn能提取更多xyz轨迹的信息，比如生成小分子量，反应元素溯源，反应路劲分析，，，虽然VMD和ovito可以做，但是都要编程，ADF可以做但是只能针对reaxff。从头算动力学出来的轨迹还没有一个好的软件可以分析。Discovering chemistry with an ab initio nanoreactor | Nature Chemistry

sobereva 发表于 2021-3-4 00:38
发现超过90度就用180度减去它

好的，谢谢。

lyj714 发表于 2021-3-3 10:16
我有个小问题请教一下，此程序给出的【0， PI/2】范围角度是如何得出的（或者说如何矫正的），因为本人以前 ...

发现超过90度就用180度减去它

我有个小问题请教一下，此程序给出的【0， PI/2】范围角度是如何得出的（或者说如何矫正的），因为本人以前写过的小程序算出来的2810帧后面的一部分平面间夹角得到的与您程序给的有大的出入。如下图：