root 发表于 2015-12-30 01:07 太谢谢你了~ |
alan 发表于 2015-12-29 23:30 是的，我觉得是没有过渡态的。 对于IRC，先不看这个曲线的形状，从两端的构型上看，就是空间取向改变了一下，能量略有下降。也就是说这个“过渡态”与解离反应无关。 再说形状，从IRC=0到附近的极大值点，能量变化其实很小，只有2个波数，是因为优化过渡态的时候收敛标准不严格，以及这个构型本来就比较软，在一般的优化步长下难以准确走到驻点。所以这个IRC也不算奇怪。 |
root 发表于 2015-12-29 23:15 所以可以在文章里说明，这个断键通过relaxed scan后，不考虑过渡态，即不考虑此断键反应路径了，是吧？谢谢~~~（这个过渡态算了好久。。） 话说，顺便提一个奇怪的现象，我求的过渡态做IRC（两个方向同时做），得到的轨迹如下图。根本不是身为过渡态的一阶鞍点图形，这个IRC路径是不是也可以从侧面反应出此过渡态的不存在？谢谢！ |
alan 发表于 2015-12-29 22:47 能量几乎是一直升高，到倒数第二个构型的时候，S与C的距离都已经超过4 $\AA$了，十有八九这个解离过程也是没有过渡态的。 最后一个点与倒数第二个构型相比在空间上的取向更稳定一些，你用倒数第二个构型做初始猜想找出来的过渡态，得到的也只会是连接了分子在空间相对取向上的两个局域极小值。 4 Angstrom已经可以算是解离产物了，再远算的意义不大。至于最后错误的结束，是因为最后一步的优化没结束，本质原因是两个碎片距离太远了，之间的相对作用力太小 |
root 发表于 2015-12-29 21:44 你好，我最近做了relaxed scan然后求过渡态，虽然求出了一个虚频不大的过渡态，但是做IRC没有得到理想的结果，我怀疑我scan找的鞍点不对（by the way,我的柔性扫描没有正常结束，但看到一个弱弱的鞍点，就拿来求过渡态了）。可以麻烦你看看我的scan为什么错误结束吗？以及，图中倒数第二点是否可以认为是鞍点？ |
alan 发表于 2015-12-29 15:32 有一个很有意思的例子是O(1D)+CH4，它有四个无过渡态的反应通道和4个有过渡态通道，感兴趣的话可以去看看，http://dx.doi.org/10.1039/C5CP04278J 
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alan 发表于 2015-12-29 15:32 从NO+O’出发，随着N与O’距离靠近，势能一路下降就能到达NO2的势阱里， 也就是说，反应路径上不会出现垒，当然也就不存在过渡态了 再比如H2O、NH3分子解离掉一个H原子，也没有过渡态，类似的例子很多很多 |
dy19930508 发表于 2015-11-21 19:27 请问你这个柔性扫描得出的结果，是怎么判断没有过渡态的呢？ |
sobereva 发表于 2015-11-21 21:25 十分感谢老师的指导！ |
dy19930508 发表于 2015-11-21 19:27 这就是说明没过渡态 键角没必要扫了，因为你柔性扫描键长的时候键角已经自动优化到最佳了。 |
liyuanhe211 发表于 2015-11-21 04:11 嗯，谢谢您的指点，十分感谢！ |
sobereva 发表于 2015-11-21 02:40 恩，我做一下柔性扫描，十分感谢sobereva老师！ |
dy19930508 发表于 2015-11-20 17:57 C 2s2, 2p2原子是个双自由基，这么搞多重度好像不大和谐 |
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