求助：MSD计算误差过大

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发布时间: 2021-3-24 10:22

我通过gromacs msd命令在计算体系中离子的扩散系数过程中出现一些问题：1.选择不同的时间长度计算MSD得到的曲线差距较大，拟合得到的扩散系数差距也较大。根据gmx msd命令，扩散系数的拟合是通过中间的80%区间计算扩 ...

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Tianze 发表于 Post on 2024-3-30 15:47:53

或许可以参考一下：
Saxton MJ. Single-particle tracking: the distribution of diffusion coefficients. Biophysical journal. 1997 Apr 1;72(4):1744-53.

yixiansheng 发表于 Post on 2024-3-28 14:30:34

我也遇到同样的问题，请问最后解决了吗.用的什么方法

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