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求助:在进行位置限制性NVT模拟时,提示the default file 'conf' does not exist

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发布时间: 2021-3-29 18:17

正文摘要:

各位老师好,我在进行NVT模拟时,输入命令gmx grompp -f nvt.mdp -r em.gro -p topol.top -o nvt.tpr但提示错误信息为: Error in user input:    Invalid input values       In ...

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lrl 发表于 Post on 2022-11-24 18:09:27
请问楼主,你的这个问题解决了吗
芮啦 发表于 Post on 2021-3-30 08:55:23
黄舒伟 发表于 2021-3-30 00:06
。。。报错的意思是你不仅要-c你还要-r

谢谢老师,我再试一试
黄舒伟 发表于 Post on 2021-3-30 00:06:27
。。。报错的意思是你不仅要-c你还要-r
芮啦 发表于 Post on 2021-3-29 23:55:20
sobereva 发表于 2021-3-29 20:11
你没用-c选项指定结构文件

谢谢sob老师,我本来是用-c指定的em.gro文件,但是它提示了以下错误信息:
Fatal error:
Cannot find position restraint file restraint.gro (option -r). From GROMACS-2018, you need to specify the position restraint coordinate files explicitly to avoid mistakes, although you can still use the same file as you specify for the -c option.
所以我就用-r指定em.gro文件了
sobereva 发表于 Post on 2021-3-29 20:11:14
你没用-c选项指定结构文件

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