加入显式水分子进行催化计算时，通过频率计算做热力学校正时要固定水分子吗？

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发布时间: 2021-4-2 11:41

求助各位老师我在催化剂表面引入了4到5个水分子，做频率计算的时候是不是只要放开吸附在表面上的反应物和水分子即可，距离表面较远4埃以上的水分子可以固定？然后通过这样计算完的频率来做热力学校正？（比如如图两 ...

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calamity 发表于 Post on 2021-4-6 20:36:51

sobereva 发表于 2021-4-3 16:20
没有什么理由要固定。而且固定的话逻辑也说不通，和现实情况也不对应

好的，才看到，谢谢sob老师

sobereva 发表于 Post on 2021-4-3 16:20:44

没有什么理由要固定。而且固定的话逻辑也说不通，和现实情况也不对应

calamity 发表于 Post on 2021-4-2 13:18:00

biogon 发表于 2021-4-2 11:53
你固定了分子做振动分析会导致虚频

我算了几个结构，固定了显式分水分子，仅吸附分子放开振动都没出现虚频，只有优化了一个H2的结构存在一个20多cm-1的虚频

biogon 发表于 Post on 2021-4-2 11:53:05

你固定了分子做振动分析会导致虚频

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