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求助：一条蛋白单体升温至600k模拟20ns后去周期性报错

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jiaxing6821

发布时间: 2021-4-4 14:56

正文摘要:

请问各位老师，本人将一条单体蛋白升温至600k模拟20ns后，在使用命令：gmxtrjconv -f md1mer20ns1.xtc-s md1mer20ns1.tpr -o Q.xtc -pbc mol -ur compact -center -n index.ndx -dt 50 去周期性时（其中centering选 ...

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jiaxing6821 发表于 Post on 2021-4-5 08:58:16

好的，谢谢sob老师！4月17号见！

sobereva 发表于 Post on 2021-4-5 02:27:34

大概率是tpr和xtc文件不对应，如果能确保对应，检查ndx文件里的组里面的原子序号是否符合当前体系的情况

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