求助：在MS中导入聚合物的晶体结构如何利用Forcite模块进行几何优化和分子动力学模...

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发布时间: 2021-4-22 20:42

如图，是从一个数据库导入MS的纤维素Iβ晶体的.cif文件，可以发现这种聚合物晶体结构文件是没有定义1条链有几个重复单元的，因此无法用Forcite模块中的力场进行几何优化和分子动力学模拟的，想问一下我要如何对这个 ...

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1148751499 发表于 Post on 2021-4-25 10:31:53

swordshine 发表于 2021-4-23 10:46
一个无限，一个有限，看你的体系和目的了

感谢感谢

swordshine 发表于 Post on 2021-4-23 10:46:27

1148751499 发表于 2021-4-23 09:02
谢谢解答，大概懂了，就是可以直接对晶体做动力学，也可以删掉端位的键补上端基做动力学，还有一个问题， ...

一个无限，一个有限，看你的体系和目的了

1148751499 发表于 Post on 2021-4-23 09:02:42

swordshine 发表于 2021-4-23 07:58
不太懂楼主的目的，Forcite是可以直接对晶体做动力学的。如果你要有限的单元，建个超胞，删掉端位的键再补 ...

谢谢解答，大概懂了，就是可以直接对晶体做动力学，也可以删掉端位的键补上端基做动力学，还有一个问题，就是这两者有什么区别吗？

swordshine 发表于 Post on 2021-4-23 07:58:34

不太懂楼主的目的，Forcite是可以直接对晶体做动力学的。如果你要有限的单元，建个超胞，删掉端位的键再补上端基就可以了。

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