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使用PyVibMS可视化分子和固体中的振动模式

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发布时间: 2021-4-28 09:47

正文摘要:

本帖最后由 smutao 于 2022-1-31 06:45 编辑 相关帖文: I. PyVibMS现已支持ORCA/xtb/Q-Chem输出 http://bbs.keinsci.com/thread-22955-1-1.html II. 使用UniMoVib+PyVibMS显示其他量化程序振动分析结果 http:/ ...

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smutao 发表于 Post on 2022-3-3 10:55:42
github访问不了的情况下,可以访问gitlab的镜像 https://gitlab.com/smutao/PyVibMS
fangyl 发表于 Post on 2025-7-4 17:56:17
请问楼主是否支持vasp6.x的输出
smutao 发表于 Post on 2024-9-6 11:20:03
miemie123 发表于 2024-1-2 15:32
老师好,请问振动模式各原子上的箭头可以调整粗细和颜色吗?怎么操作呢?

试试 修改 https://github.com/smutao/PyVibMS/blob/master/src/cgo_arrow.py 文件
smutao 发表于 Post on 2024-9-6 11:17:50
damao4361556 发表于 2023-12-16 16:16
请问下 如何具体得到 mode可视化动画中每一步结构所对应的坐标?

这个需要小改代码
应该把 类似 os.remove("vib_xyz.xyz") 的代码注释掉,每一帧的结构文件就保留了 可以试试
smutao 发表于 Post on 2024-9-6 11:15:24
QEQEIop 发表于 2023-6-3 18:00
大佬,QE的输出文件到.mode文件有没有快捷的教程?

可以把文件发到我邮箱(在插件的关于信息里有) 我看看能不能支持QE
miemie123 发表于 Post on 2024-1-2 15:32:09
老师好,请问振动模式各原子上的箭头可以调整粗细和颜色吗?怎么操作呢?
damao4361556 发表于 Post on 2023-12-16 16:16:44
请问下 如何具体得到 mode可视化动画中每一步结构所对应的坐标?
QEQEIop 发表于 Post on 2023-6-3 18:00:38
大佬,QE的输出文件到.mode文件有没有快捷的教程?
wangy0822 发表于 Post on 2022-3-8 14:27:40
本帖最后由 wangy0822 于 2022-3-8 14:30 编辑
smutao 发表于 2022-3-8 10:27
因为代码里面写死了 没有加可调功能
好的,感谢您的解答
smutao 发表于 Post on 2022-3-8 10:27:08
wangy0822 发表于 2022-3-3 14:50
supercell之后为啥这么多,不能指定做多大的超胞吗?

因为代码里面写死了 没有加可调功能
wangy0822 发表于 Post on 2022-3-3 14:50:28
supercell之后为啥这么多,不能指定做多大的超胞吗?
wangy0822 发表于 Post on 2021-11-12 15:55:51
wangy0822 发表于 2021-11-12 15:22
你好,我保存振动的动图出现了这个问题,请问怎么解决

不好意思,没看到上面的方法,已解决
wangy0822 发表于 Post on 2021-11-12 15:22:29
你好,我保存振动的动图出现了这个问题,请问怎么解决

QQ截图20211112152011.png (85.63 KB, 下载次数 Times of downloads: 126)

QQ截图20211112152011.png
daoshiliu 发表于 Post on 2021-5-24 16:32:31
smutao 发表于 2021-5-11 05:03
可能是需要在配置python环境的时候 加上PyQt5这个组件

见 https://pymolwiki.org/index.php/Windows_I ...

谢谢您的回复,安装pyqt5后解决了那个问题

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