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计算溶剂下吉布斯自由能

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发布时间: 2015-12-2 21:22

正文摘要:

sob 老师说 用M052X/6-31G* scrf=(smd,solvent=dichloromethane)的单点能减去M052X/6-31G*的单点能,得到溶解自由能,加到热力学组合方法算的气相自由能上,得到溶剂下的自由能。1、溶解自由能如何获得?输入文件( ...

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zhangchenyang 发表于 Post on 2015-12-3 10:40:13
liyuanhe211 发表于 2015-12-2 22:46
人家告诉你要用“M052X/6-31G* scrf=(smd,solvent=dichloromethane)”即SMD方法计算溶剂化热,你非要用“sc ...

谢谢老师。
zhangchenyang 发表于 Post on 2015-12-3 10:39:45
sobereva 发表于 2015-12-2 23:05
1 都已经说得清楚得不能再清楚了啊,关键词都给出来了,干嘛非要用和我说的不一样的关键词啊。不要加其它任 ...

谢谢老师,就让老师的办,因为在重复一篇文献,他就是那么做的,我决定按老师的来。
liyuanhe211 发表于 Post on 2015-12-3 00:11:16
一般算SMD的△G_sol是为了算反应前后的△△G_sol,所以那个校正其实没用。

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sobereva 发表于 Post on 2015-12-2 23:05:28
1 都已经说得清楚得不能再清楚了啊,关键词都给出来了,干嘛非要用和我说的不一样的关键词啊。不要加其它任何关键词!
我说的单点能就是一般意义的单点能,即single point energy,不要做freq计算!
我说的做法就是获得溶解自由能最最最最最最标准的做法。用不着考虑其它任何情况。
你的做法得到的溶解自由能一定比我说的做法的精度差。
IEFPCM的参数根本就不是对CCSD/6-311+G(df,p)级别参数化的,结果不可能好。看看这篇你就知道:J. Phys. Chem. A 2010, 114, 13442–13444。文中的图很明显,用MP2的结果还没用HF的好。一定要搞明白溶剂模型是对指定计算级别进行参数化的,绝对绝对绝对不是理论方法和基组越大越好,用高级别理论方法和基组计算溶解自由能只会适得其反。

2 “溶剂下的自由能=溶解自由能+气相的自由能”这就是对的
用不用那个所谓的修正看你用的是什么参考态,这由你自己决定


3 溶解自由能必须同时考虑溶剂的极性和非极性才准确。scrf=SMD输出的单点能已经包含了这两者。你说的那个After PCM corrections后面的值根本就没包含非极性部分。


Summary:按我说的做法算,一定没错,不要想太多。
如果非要知道所以然,把前面说的JPCA文章看了,把SMD原文看了,把Essentials of Computational Chemistry-Theories and Models(2ed,Cramer)的溶剂模型部分看了。不要凭主观和文献里的只言片语去猜。

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卡开发发 + 5 我很赞同

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liyuanhe211 发表于 Post on 2015-12-2 22:46:41
人家告诉你要用“M052X/6-31G* scrf=(smd,solvent=dichloromethane)”即SMD方法计算溶剂化热,你非要用“scf=iefpcm”,然后argue说各种不一样,让人家说啥呢╮(╯▽╰)╭。

SMD是计算溶剂化自由能较准确地方法,一定要用IEFPCM那就用吧。

单点能就是“Electronic Energy”,Sum of electronic and zero-point Energies = Electronic Energy + zero-point Energy != Electronic Energy

单点能是SCF做完之后吐出来那个数,按照SMD的最优水平应该显示为E(M052X)=XXX

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