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用gromacs根据教程跑水中的蛋白,模拟体系是一个蛋白和125个水分子在180K下npt系综下跑1ns。查看md.gro也没有跑散,但是查看密度,100ps-200ps间出现一小段等与0的情况,后面又稳定在一个新的值,但是跟预平衡时不一 ...
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