可以从100ns作为MSD曲线的计算起点看看MSD曲线是什么样

土拔鼠 发表于 2021-5-4 16:00
你好 我第一次算这个MSD 是审稿人要求我加的 我的体系是由A B两种溶剂组成的 AB不互溶 A和B的摩尔比是1： ...

你得知道你算的分子的扩散是在什么时间尺度下的。另外，MSD计算中，delta t越大，数据越少，曲线越不准。经验上看，用来拟合的区间最好别超过轨迹总长度的1/2，。

把除扩散溶剂以外的溶液固定试试

k64_cc 发表于 2021-5-4 14:06
我觉得你还是先研究研究为什么不直为好。

你好 我第一次算这个MSD 是审稿人要求我加的 我的体系是由A B两种溶剂组成的 AB不互溶 A和B的摩尔比是1：10 我算的是A的MSD 我现也在不太清楚我该怎么解释这个MSD的曲线 也不太清楚应该取哪一段去算扩散系数 我看20 ns—100 ns和100 ns—180 ns都是相对平整的 因为是混合体系也没有实验值可以借鉴

我觉得你还是先研究研究为什么不直为好。