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VMD分析氢键遇到错误

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发布时间: 2021-5-9 17:37

正文摘要:

我用VMD分析Hydrogen bonds时出现了如下的错误,不知道怎么修改呢?我设置的是:

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sobereva 发表于 Post on 2022-5-30 06:47:56
sobereva 发表于 Post on 2022-5-30 06:47:53
LSY0202 发表于 2021-8-26 11:04
所以你是怎么设置的啊,我也遇到了和你相同的问题

http://bbs.keinsci.com/thread-30011-1-1.html
s541040349 发表于 Post on 2022-5-17 21:19:53
你好,请问解决了吗
LSY0202 发表于 Post on 2021-8-26 11:04:15

所以你是怎么设置的啊,我也遇到了和你相同的问题
爱模拟的bao 发表于 Post on 2021-5-11 09:44:26
sobereva 发表于 2021-5-11 05:43
选区没设对
光写name O肯定不行,程序根据给体重原子和相连的氢一起来判断给体原子

好的,谢谢老师。
sobereva 发表于 Post on 2021-5-11 05:43:51
爱模拟的bao 发表于 2021-5-10 11:20
老师,我可以在VMD里看到氢键",但是计算出来的氢键都是零呢,这是什么原因啊?

选区没设对
光写name O肯定不行,程序根据给体重原子和相连的氢一起来判断给体原子
爱模拟的bao 发表于 Post on 2021-5-10 15:51:18
sobereva 发表于 2021-5-10 13:43
贴图方式不对,其他人看不到。重新编辑帖子并仔细看置顶的新社员必读贴了解怎么正确贴图

修改了呢,老师。
sobereva 发表于 Post on 2021-5-10 13:43:24
爱模拟的bao 发表于 2021-5-10 11:20
老师,我可以在VMD里看到氢键,但是计算出来的氢键都是零呢,这是什么原因啊?

贴图方式不对,其他人看不到。重新编辑帖子并仔细看置顶的新社员必读贴了解怎么正确贴图
爱模拟的bao 发表于 Post on 2021-5-10 08:14:29
sobereva 发表于 2021-5-10 03:33
至少对于1.9.3版,VMD的绘图功能有bug,把Plot the data with Multiplot取消掉

好的呢,谢谢了呢,我试试呢。
sobereva 发表于 Post on 2021-5-10 03:33:00
至少对于1.9.3版,VMD的绘图功能有bug,把Plot the data with Multiplot取消掉

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