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求助:氧化石墨烯与蛋白体系在em时进行grompp出现error

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发布时间: 2021-5-12 15:54

正文摘要:

请问老师们,我在对氧化石墨烯与蛋白的模拟中做能量最小化时出现了错误:Energy group exclusions are not (yet) implemented for the Verlet scheme,请问是什么原因造成的,是mdp文件设置出问题了吗

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行行真的行 发表于 Post on 2021-5-13 10:40:59
sobereva 发表于 2021-5-13 07:11
本来就没必要写energygrp-excl

PS:这模板槽点太多

确实感觉加了很多不必要的,但是是跟着文献做的,我之前按照您培训班的模板做的还挺顺利的,就是怕缺失一些条件,但现在看来可能多了一些不必要的选项
sobereva 发表于 Post on 2021-5-13 07:11:11
本来就没必要写energygrp-excl

PS:这模板槽点太多
行行真的行 发表于 Post on 2021-5-12 19:31:47
谢谢!
王采岑 发表于 Post on 2021-5-12 17:27:22
行行真的行 发表于 2021-5-12 16:50
不好意思,这是当时不小心搞错的,错误与这个无关

人建议用group,网址给你,看看https://gromacs.org-gmx-users.ma ... de-lipid-simulation
行行真的行 发表于 Post on 2021-5-12 16:50:05
本帖最后由 行行真的行 于 2021-5-12 19:09 编辑
王采岑 发表于 2021-5-12 16:27
不知道有没有影响,但你verlet拼错了

不好意思,这是当时不小心搞错的,但错误与这个无关
王采岑 发表于 Post on 2021-5-12 16:27:39
本帖最后由 王采岑 于 2021-5-12 16:28 编辑

不知道有没有影响,但你verlet拼错了

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