求助：关于Merz离子参数的使用

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发布时间: 2021-5-15 15:01

请问文献中Merz力场参数直接用于Gromacs中是不是就直接把Rmin,M/2(A)乘以2当作amber力场中的sigma,第二个参数乘以4.184当作amber力场中的epsilon就可以了？

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FlawlessBee 发表于 Post on 2024-3-10 02:01:00

请问epsilon的转化是直接乘以4.184吗？

xjw 发表于 Post on 2022-4-13 21:13:30

HZW 发表于 2022-4-13 19:15
AmberTools21里边有，或者去amber官网找Force Fields的Ion Parameters有介绍

好的。谢谢哈。

HZW 发表于 Post on 2022-4-13 19:15:34

xjw 发表于 2022-4-13 17:40
您好，请问这个Merz的参数在哪可以看到啊

AmberTools21里边有，或者去amber官网找Force Fields的Ion Parameters有介绍

xjw 发表于 Post on 2022-4-13 17:40:20

您好，请问这个Merz的参数在哪可以看到啊

邱美佳 发表于 Post on 2021-5-15 20:33:29

sobereva 发表于 2021-5-15 16:48
否
R_min是平衡距离，即下图的r0。而sigma是LJ势作用为0的位置

太感谢卢老师了，差点就用错的参数去算了

sobereva 发表于 Post on 2021-5-15 16:48:41

否
R_min是平衡距离，即下图的r0。而sigma是LJ势作用为0的位置

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