计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

求助过渡态用CCSD(T)计算单点能后能量低于前一中间态

查看数: 21078 | 评论数: 15 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2021-5-17 15:39

正文摘要:

各位老师好, 在利用m062x/def2tzvpp寻找过渡态后,其IRC如图,(它确实连接反应物和产物,不知这样是否认为合理)。再通过ccsd(t)/aug-cc-pvtz计算单点能后得到的过渡态能量小于前一个中间态,甚至我把IRC左端的 ...

回复 Reply

lyt0226 发表于 Post on 2021-5-18 14:23:13
zjxitcc 发表于 2021-5-18 12:42
那你只能仍旧用m062x/def2tzvpp。不过我有一点不太理解:既然你自己都说用M062X/def2TZVPP做结构优化、找 ...

因为那会关注在stable=opt上,只想说尝试一下这个计算,还没有和自己其他计算结合起来。

非常感谢老师的耐心解答!受益良多!
zjxitcc 发表于 Post on 2021-5-18 12:42:52
本帖最后由 zjxitcc 于 2021-5-18 12:44 编辑
lyt0226 发表于 2021-5-18 11:34
好的,谢谢老师!

不好意思,但是还有一个问题是因为关于这个体系我已经算好了其他路径(都是涉及五六个 ...

那你只能仍旧用m062x/def2tzvpp。不过我有一点不太理解:既然你自己都说用M062X/def2TZVPP做结构优化、找过渡态,用CCSD(T)算单点;那你为何在6L中又展示出你想用CCSD(T)优化结构呢?
lyt0226 发表于 Post on 2021-5-18 11:34:03
好的,谢谢老师!

不好意思,但是还有一个问题是因为关于这个体系我已经算好了其他路径(都是涉及五六个过渡态),他们的结构优化都用的是m062x/def2tzvpp(ZPE),计算单点能用的都是ccsd(t)/aug-cc-pvtz,那在这个stable=opt以及双杂化泛函优化之后还能做到和其他路径统一吗?包括能量计算等
zjxitcc 发表于 Post on 2021-5-18 11:19:06
lyt0226 发表于 2021-5-18 11:04
不好意思老师,可能我没有描述清楚

比如用B2PLYP-D3(BJ)读取stable=opt结果进行优化的时候输入文件“# ...

合理。如果你的体系不是阴离子的话,双杂化泛函做结构优化这步,基组用def2-TZVP足矣。另外,做完结构优化,对优化结果进行波函数稳定性分析当然是一种好习惯,但是接着还要做freq任务确认没有虚频(即优化出的是局域极小点)。
lyt0226 发表于 Post on 2021-5-18 11:04:36
zjxitcc 发表于 2021-5-18 10:51
“选取不那么昂贵的计算级别,重复进行稳定性检测,最后再用CCSD读取该chk档下的结构计算单点能”不明白 ...

不好意思老师,可能我没有描述清楚

比如用B2PLYP-D3(BJ)读取stable=opt结果进行优化的时候输入文件“#p opt B2PLYP/aug-cc-pvtz em=gd3bj guess=read geom=check”,对优化结果进行进一步稳定性分析后,直接用优化结果在CCSD(T)/aug-cc-pvtz下进行单点能计算。这样合理吗?

谢谢您!
zjxitcc 发表于 Post on 2021-5-18 10:51:39
lyt0226 发表于 2021-5-18 10:43
谢谢老师!

确实有,我就是不确认怎么把这个优化的结果应用到后面的单点能计算中,我查看帖子里面理解 ...

“选取不那么昂贵的计算级别,重复进行稳定性检测,最后再用CCSD读取该chk档下的结构计算单点能”不明白在说啥。。
lyt0226 发表于 Post on 2021-5-18 10:43:42
snljty 发表于 2021-5-18 10:26
Gaussian的CCSD(T)没有一阶解析导数,硬用数值导数会奇慢无比。通常没必要这个级别优化,非要用的话要指 ...

谢谢老师,明白了!
lyt0226 发表于 Post on 2021-5-18 10:43:14
zjxitcc 发表于 2021-5-18 10:27
如果你真的写了stable=opt,而非仅仅是stable,那么在The wavefunction has an RHF -> UHF instability提 ...

谢谢老师!

确实有,我就是不确认怎么把这个优化的结果应用到后面的单点能计算中,我查看帖子里面理解的是用stable=opt后再利用opt优化,所以老师如果我想利用stable=opt的结果只需要读取chk文档,选取不那么昂贵的计算级别,重复进行稳定性检测,最后再用CCSD读取该chk档下的结构计算单点能就可以是吗?

zjxitcc 发表于 Post on 2021-5-18 10:27:49
本帖最后由 zjxitcc 于 2021-5-18 10:32 编辑
lyt0226 发表于 2021-5-18 10:20
sob老师,

我在利用#p HF/aug-cc-pvtz stable=opt 分析稳定性后得到稳定性结果结果“The wavefunction ...

如果你真的写了stable=opt,而非仅仅是stable,那么在The wavefunction has an RHF -> UHF instability提示后,高斯会优化波函数至稳定,因此你还会观察到The wavefunction is already stable字样,建议检查一下。

你这体系CCSD(T)结构优化是算不动的,可以考虑用 双杂化泛函 优化结构(同样仍需检验波函数稳定性),用CCSD(T)算电子能量。
单点计算无需写sp关键词,默认就是单点计算。而且你结构优化和单点计算的方法/基组一模一样,这表示你无需额外进行单点计算,结构优化的输出文件里就有能量,无需再画蛇添足算单点。
snljty 发表于 Post on 2021-5-18 10:26:36
lyt0226 发表于 2021-5-18 10:20
sob老师,

我在利用#p HF/aug-cc-pvtz stable=opt 分析稳定性后得到稳定性结果结果“The wavefunction ...

Gaussian的CCSD(T)没有一阶解析导数,硬用数值导数会奇慢无比。通常没必要这个级别优化,非要用的话要指定被优化的变量。
lyt0226 发表于 Post on 2021-5-18 10:20:37
sobereva 发表于 2021-5-17 23:11
对HF波函数进行检测(写HF而非CCSD(T)),因为CCSD(T)是以HF波函数为参考态的

sob老师,

我在利用#p HF/aug-cc-pvtz stable=opt 分析稳定性后得到稳定性结果结果“The wavefunction has an RHF -> UHF instability”,
(1)那我后面如果想继续优化是不是应该采用“#p opt CCSD(T)/aug-cc-pvtz guess=read geom=check”,(2)用优化结果进一步进行CCSD(T)/aug-cc-pvtz下的单点能计算的时候,用“#p CCSD(T)/aug-cc-pvtz sp guess=read geom=check”是否正确?

谢谢老师的解答!
sobereva 发表于 Post on 2021-5-17 23:11:04
lyt0226 发表于 2021-5-17 22:33
sob老师,我在尝试stable=opt检验CCSD(t)下的稳定性的时候总是出现“Error termination in NtrErr:NtrE ...

对HF波函数进行检测(写HF而非CCSD(T)),因为CCSD(T)是以HF波函数为参考态的
lyt0226 发表于 Post on 2021-5-17 22:33:49
sobereva 发表于 2021-5-17 16:43
说明m062x/def2tzvpp找出来的驻点位置和更精确势能面下的驻点偏离较大
当前体系电子结构较复杂,M06-2X这 ...

sob老师,我在尝试stable=opt检验CCSD(t)下的稳定性的时候总是出现“Error termination in NtrErr:NtrErr Called from FileIO.”错误,换了高斯的版本/增大运行内存都没有解决,但是换了算法和基组就能够正常运行,这应该怎么解决?

谢谢老师
lyt0226 发表于 Post on 2021-5-17 17:35:32
好的,明白了!谢谢sob老师的解答!

我尝试一下!

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-17 07:15 , Processed in 0.176202 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list