sobereva 发表于 2021-10-30 10:19
默认情况VMD按照volume方式着色用的正是autoscale方式，也就是将数值下限和上限分别作为色彩刻度的下限和 ...

好的，谢谢sob老师

SchrodingersCat 发表于 2021-10-30 08:32
在VMD里面可以调autoscale，因为按教程默认data range是-50~50，一个纯阴离子肯定小于0，自然都是蓝色的， ...

默认情况VMD按照volume方式着色用的正是autoscale方式，也就是将数值下限和上限分别作为色彩刻度的下限和上限。由于对于中性体系，这没法让静电势为0的情况正好对应于最白色，所以我的脚本里用了对于中性体系普遍比较合适的上下限。
对于离子体系是可以用autoscale按钮直接自动设置，不过此时上、下限的数值不够整，所以建议再手动调得整一些。

在VMD里面可以调autoscale，因为按教程默认data range是-50~50，一个纯阴离子肯定小于0，自然都是蓝色的，所以得调。我刚做完一个内盐阳离子，可以看看。（我昨天也是遇到一样的问题，才摸索出来的，不知道对不对，欢迎讨论）

yiping_rw 发表于 2021-5-18 18:53
对的老师，是阴离子，所以优化的时候加了弥散函数6-311+g(d,p)。

PS：好的老师，第一次发帖，为清楚直 ...

阴离子本来就这样

sobereva 发表于 2021-5-18 18:17
体系是阴离子？

PS：发图时别把Multiwfn保存出的图片直接上传。默认设置下直接保存的图像像素高，文件尺 ...

对的老师，是阴离子，所以优化的时候加了弥散函数6-311+g(d,p)。

PS：好的老师，第一次发帖，为清楚直观说明问题才附了图片，以后会注意调整尺寸的。

体系是阴离子？

PS：发图时别把Multiwfn保存出的图片直接上传。默认设置下直接保存的图像像素高，文件尺寸大，浪费服务器空间，加载也慢。应当把尺寸调整合适再发