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求助：CP2K使用PBE泛函进行几何优化出现极其怪异的崩溃结构

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xexlalalan

发布时间: 2021-5-21 13:20

正文摘要:

近日使用我们学校超算中心编译的CP2K 7.1的PBE泛函对一个吸附有过硫酸根、水的矿物表面进行几何优化时（用钠离子做电荷平衡），发现优化所得的结果十分离谱，仿佛彻底散架一般，没有任何化学意义。更换赝势、基组， ...

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xexlalalan 发表于 Post on 2021-5-23 13:09:47

jiangning198511 发表于 2021-5-21 15:38
&POISSON
PERIODIC NONE #Direction(s) of PBC for calculating electrostatics
PSOLVER ...

非常感谢！确实是POISSION没有设置。设置成XYZ之后就完全正常了！

xexlalalan 发表于 Post on 2021-5-22 12:47:18

jiangning198511 发表于 2021-5-22 09:17
我看了一下INPUT的结构，你这个结构是两边吸附吗？部分水貌似在真空层里面

是只有一边吸附的，另一边是拿钠进行电荷平衡。一开始的时候想加溶剂模型，因为单独一个钠离子极性太大，怕溶剂模型不好收敛，所以就给他用了显式溶剂。结果还是不好收敛，就又把隐式模型去掉了……但是模型懒得改了，索性这么算了

jiangning198511 发表于 Post on 2021-5-22 09:17:42

xexlalalan 发表于 2021-5-21 17:07
谢谢！我改一下poisson。请问结构具体哪里有问题呢？

我看了一下INPUT的结构，你这个结构是两边吸附吗？部分水貌似在真空层里面

xexlalalan 发表于 Post on 2021-5-21 17:07:17

jiangning198511 发表于 2021-5-21 15:44
你的INP文件中的结构构建也有问题

谢谢！我改一下poisson。请问结构具体哪里有问题呢？

jiangning198511 发表于 Post on 2021-5-21 15:44:13

你的INP文件中的结构构建也有问题

jiangning198511 发表于 Post on 2021-5-21 15:38:24

&POISSON
PERIODIC NONE #Direction(s) of PBC for calculating electrostatics
PSOLVER ANALYTIC #The way to solve Poisson equation
&END POISSON
这里为啥选择NONE,表面的话应该是XY

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