能否利用Gaussian绘制分子间相互作用等值面？

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发布时间: 2021-5-25 09:21

我看文献中（10.1002/adfm.202010535）有如下图建立了A-B-A类型的复合物结构，绘制右侧等值面来直观查看两分子间各部分的库伦相互作用，请问这样的等值面如何结合Gaussian的数据绘制？

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sobereva 发表于 Post on 2021-5-25 10:32:08

Gaussian自身不行，必须结合Multiwfn。仔细看

使用Multiwfn图形化研究弱相互作用
http://sobereva.com/68
使用Multiwfn做NCI分析展现分子内和分子间弱相互作用
https://www.bilibili.com/video/av71561024
用Multiwfn+VMD做RDG分析时的一些要点和常见问题
http://sobereva.com/291（http://bbs.keinsci.com/thread-1206-1-1.html）
通过独立梯度模型(IGM)考察分子间弱相互作用
http://sobereva.com/407（http://bbs.keinsci.com/thread-9472-1-1.html）
使用Multiwfn结合CP2K通过NCI和IGM方法图形化考察固体和表面的弱相互作用
http://sobereva.com/588（http://bbs.keinsci.com/thread-21742-1-1.html）
使用Multiwfn做aNCI分析图形化考察动态过程中的蛋白-配体间的相互作用
http://sobereva.com/591（http://bbs.keinsci.com/thread-21826-1-1.html）

snljty 发表于 Post on 2021-5-25 09:34:43

这个图显示的不只是库伦相互作用。看卢老师博文《使用Multiwfn图形化研究弱相互作用》 http://sobereva.com/68
以及可以在Multiwfn手册里也看看IGMH分析和IRI分析的相关内容

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