求助：用alchemical_analysis计算联苯的溶剂化自由能得到诡异的重叠分布图该如何改进

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发布时间: 2021-5-26 10:50

如题，我的自由能计算参数设置如下： free-energy = yes couple-moltype = BIP couple-lam ...

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Jeffrey0521 发表于 Post on 2023-7-28 16:09:08

您好，想问下有解决吗？我看到有人说增加窗口，有人说减少窗口，我不知道该怎么搞了

活性炭 发表于 Post on 2022-6-8 15:13:56

王家小姐发表于 2022-5-16 16:59
您好，我判断的标准是对角线面积很大，可以减少些窗口，我是隔一个减少一个

好的，谢谢回复！

王家小姐 发表于 Post on 2022-5-16 16:59:09

活性炭发表于 2022-3-14 16:04
请问，如何判断哪些个窗口应该减少呢？

您好，我判断的标准是对角线面积很大，可以减少些窗口，我是隔一个减少一个

活性炭 发表于 Post on 2022-3-14 16:04:24

王家小姐发表于 2022-2-28 18:32
我计算的时候也遇到过这种情况，是因为所取的窗口太密集了，减少几个窗口应该可以解决这个问题

请问，如何判断哪些个窗口应该减少呢？

王家小姐 发表于 Post on 2022-2-28 18:32:29

我计算的时候也遇到过这种情况，是因为所取的窗口太密集了，减少几个窗口应该可以解决这个问题

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