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使用Cygwin编译适用于Windows版本的amber18（含有xleap）

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Chris——szk

发布时间: 2021-6-1 20:12

正文摘要:

自己在最近兴趣来了就尝试着使用Cygwin编译了amber18，主要的问题应该还是在nab，mmpbsa.py，pdb4amber这三个模块上有点问题，编译不出来，综合了各个版本，发现了amber18最适用于现在最新版本的Cygwin64，其余版本 ...

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大村驴 发表于 Post on 2024-11-2 14:47:14

解决了，原来是我加的环境变量“/”写成“\”了

大村驴 发表于 Post on 2024-10-21 20:14:43

student0618 发表于 2024-10-21 17:51
我自己直接在笔记本电脑WSL 的Ubuntu编译，用了几年都没问题。(主要用来建模的，MD放linux的机器跑)

我试试

student0618 发表于 Post on 2024-10-21 17:51:58

本帖最后由 student0618 于 2024-10-21 17:56 编辑

我自己直接在笔记本电脑WSL 的Ubuntu编译，用了几年都没问题。(主要用来建模的，MD放linux的机器跑)

大村驴 发表于 Post on 2024-10-21 17:34:57

链接失效了，能否麻烦补一下呢~
另外请问大佬是否尝试过不用cygwin，直接原生编译？我用之前的amber16的cygwin版本的时候，如果用其他语言的源码调用antechamber，会出现无法识别bondtype命令的问题（在PATH里），而直接命令行使用bondtype是能用的。我经过排查之后怀疑极大可能是cygwin在二级调用时候无法识别反斜杠的问题，所以想看看原生编译能不能解决。

Chris——szk 发表于 Post on 2021-6-2 12:00:01

非常的不好意思，上次没有放上链接应该是可以使用的，在cygwin64的环境下应该要安装上Cygwin64-X,使用X-Term之后才可以使用gedit和xleap等工具模块，其中在使用xleap的时候应该要装上一系列的dll文件，都在amber18/bin里这个目录里可以找到

链接：https://pan.baidu.com/s/1k_ea28bAwF_Oyjgb2t-AmQ

提取码：v1uv

Chris——szk 发表于 Post on 2021-6-2 11:59:23

sobereva 发表于 2021-6-2 05:40
没看到你提供的可执行文件

好的好的，谢谢sob老师提醒，非常抱歉忘记放上了链接

sobereva 发表于 Post on 2021-6-2 05:40:57

没看到你提供的可执行文件

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