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求助:xTB运行程序优化过程崩溃

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发布时间: 2021-6-7 22:38

正文摘要:

本帖最后由 SpongeBob 于 2021-6-8 08:55 编辑 我在尝试用xTB计算时出现了一些问题。我的体系中包含五个BH4-,一个TFSI-,和一个Mg2+,应用命令xtb xtb.xyz --chrg -4 --uhf 0 --gfn 1 --omd -I md.inp,却无法运 ...

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SpongeBob 发表于 Post on 2021-6-10 08:27:07
SherryLiu 发表于 2021-6-10 06:09
下图是我用gfn 2 优化的结构,但在md.inp 里加了势函数以保持离子间的相互作用,结构似乎比较合理。
另外 ...

产生这个现象的原因很可能是溶剂效应,我会去尝试一下,谢谢
SpongeBob 发表于 Post on 2021-6-10 08:26:20
sobereva 发表于 2021-6-8 19:39
体系里那么多阴离子,整体带显著负电荷,在真空下可不容易通过静电斥力崩飞了

嗯嗯,谢谢sob老师。
SherryLiu 发表于 Post on 2021-6-10 06:09:00
下图是我用gfn 2 优化的结构,但在md.inp 里加了势函数以保持离子间的相互作用,结构似乎比较合理。
另外不知道这个体系是否需要考虑溶剂效应,楼主可以试试看是否有所差异。
此外,gfn 0, 1, 2 可能适合某种体系可能不适合某种体系,需要根据具体的研究的体系确定。
$wall
   potential=logfermi
   sphere: auto, all
$end
$cma

202106100558592603..png (10.21 KB, 下载次数 Times of downloads: 24)

202106100558592603..png
sobereva 发表于 Post on 2021-6-8 19:39:18
体系里那么多阴离子,整体带显著负电荷,在真空下可不容易通过静电斥力崩飞了
SpongeBob 发表于 Post on 2021-6-8 08:54:53
hdhxx123 发表于 2021-6-7 22:49
贴的图里写了,结构不合理不收敛,建议先用gfn0优化或者其他半经验方法优化一下。

我尝试过用gfn0和gfn2进行优化,都可以优化成功,但是优化的结果似乎不合理。我把图放在了第一层。
hdhxx123 发表于 Post on 2021-6-7 22:49:08
贴的图里写了,结构不合理不收敛,建议先用gfn0优化或者其他半经验方法优化一下。

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