MMFF拓扑文件力场参数怎么设置？

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发布时间: 2021-6-17 16:47

想用MMFF力场模拟低共熔溶剂，在SwissParam上上传了mol2文件，之后只有itp文件，拓扑文件里没有如下图（amber力场的）所示这一项，请问这一项在MMFF力场中分别应该怎么设置呢？附件是生成的itp文件。谢谢各位老师

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sobereva 发表于 Post on 2021-6-18 18:52:14

二饼妹发表于 2021-6-18 11:21
老师我之前试过GAFF力场，想再找个力场模拟对比一下，看文献里模拟低共熔溶剂用的是GAFF和MMFF，就想尝试 ...

别盲目效仿文献，跟MMFF比这个没意义
要比也是和OPLS-AA、CGenFF比

二饼妹 发表于 Post on 2021-6-18 11:21:06

sobereva 发表于 2021-6-18 01:40
MMFF力场根本就不适合凝聚相模拟，甭用这个

其它能用的多得是

老师我之前试过GAFF力场，想再找个力场模拟对比一下，看文献里模拟低共熔溶剂用的是GAFF和MMFF，就想尝试一下MMFF。请问还有哪个力场比较合适呢？

sobereva 发表于 Post on 2021-6-18 01:40:08

MMFF力场根本就不适合凝聚相模拟，甭用这个

其它能用的多得是
几种生成有机分子GROMACS拓扑文件的工具
http://sobereva.com/266（http://bbs.keinsci.com/thread-428-1-1.html）

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