陈AG 发表于 2025-4-9 09:53 Distance between the two geometry centers是两个片段的几何中心的距离，不是质心距离，但一般差不了多少 |
sobereva 发表于 2025-4-9 03:42 老师，比如这些分子，结构载入Multiwfn，选主功能100的子功能21，然后输入dist，之后输入两个片段（D/A）的原子序号，读取Distance between the two geometry centers作为两个片段间的质心距离 |
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陈AG 发表于 2025-4-8 19:59 没有具体结构、没有你输入的具体没命令（直接体现怎么定义的片段），我无法判断 |
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| + 1 | 谢谢 |
sobereva 发表于 2021-6-20 18:19 老师，请问这个可以来描述空间电荷转移TADF分子的给体受体之间的质心距离吗，Distance between the two geometry centers: 5.1201 Angstrom Distance between the two mass centers: 4.9206 Angstrom |
sobereva 发表于 2021-6-20 18:19 嗯嗯收到，谢谢老师！ |
yang2020 发表于 2021-6-19 13:23 Multiwfn里直接就能测量两个片段间最近原子间距离 复合物结构载入Multiwfn，选主功能100的子功能21，然后输入dist，之后输入两个片段的原子序号即可，读Minimum distance，例如 Minimum distance: 1.9372 Angstrom, between 9(H ) and 20(O ) Maximum distance: 9.6922 Angstrom, between 13(H ) and 25(H ) Geometry center of fragment 1 (X/Y/Z): -2.5565 -0.0291 0.1320 Angstrom Geometry center of fragment 2 (X/Y/Z): 2.5565 0.0291 -0.1320 Angstrom Distance between the two geometry centers: 5.1201 Angstrom Mass center of fragment 1 (X/Y/Z): -2.5002 0.1687 0.0510 Angstrom Mass center of fragment 2 (X/Y/Z): 2.4172 0.2007 -0.1225 Angstrom Distance between the two mass centers: 4.9206 Angstrom |
yang2020 发表于 2021-6-19 16:07 有些可视化软件支持做这个，比如mercury。其他软件是否支持不太清楚 |
wzkchem5 发表于 2021-6-19 16:42 请问老师作下面分子的平均平面是怎么操作呢？ |
yang2020 发表于 2021-6-19 06:23 可以先作下面分子的平均平面，再取上面分子的原子里离这个平均平面最近的那个原子，对应的距离就是两个分子之间的距离 |
zjxitcc 发表于 2021-6-19 12:47 感谢老师的提醒。我也觉得看到的文献中拿距离说结合强度是不靠谱的。但是我想单纯了解一下图中两个片段之间的距离，这样比较直观形象地表现一下两个片段的相对空间位置状态。不知道怎么该选取两个片段中的原子作为距离的两端。 |
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拿距离判断结合强度完全不靠谱 结合能又不是不能算，而且Multiwfn还支持一大堆分析方法，光看距离完全没意义 Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览 http://sobereva.com/252 |
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