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求助：gromacs分析蛋白质小分子复合物

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年年是陶大猫

发布时间: 2021-6-20 12:54

正文摘要:

本帖最后由年年是陶大猫于 2021-6-20 15:51 编辑已经分别生成了蛋白质和小分子的top文件，并且生成了complex.gro文件，请问之后进行什么步骤呢？

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sobereva 发表于 Post on 2021-6-20 18:09:25

gro和top都有了，结合mdp用grompp产生tpr文件开始跑就完了

PS：感觉你严重欠缺最基本的基础，最好参加北京科音的分子动力学与GROMACS培训班系统学一次，就什么都明白了 http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html

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