求助 GMX mdrun怎么调用双路的cpu呢？

查看数: 5293 | 评论数: 4 | 收藏 Add to favorites 1

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2021-6-27 14:01

先前在参考sob老师配置推荐的博文下，组装了一台双路2696v4的机器，由于现在显卡价格还是不太满意，所以暂用亮机卡点亮。机器本来想装双系统，不过现在就装了win10（打算等到显卡就位再折腾）。在做虚拟筛选的时候2 ...

回复 Reply

5撇到3撇 发表于 Post on 2021-6-28 11:13:37

sobereva 发表于 2021-6-28 06:58
搞清楚什么叫节点
一台机子是一台节点

好的谢谢老师我再研究研究

sobereva 发表于 Post on 2021-6-28 06:58:24

5撇到3撇发表于 2021-6-27 21:22
谢谢老师解答，刚才试了一下还是不行:( 我猜测是因为只能用一个节点所以另一个cpu就闲置了嘛，老师我是小 ...

搞清楚什么叫节点
一台机子是一台节点

5撇到3撇 发表于 Post on 2021-6-27 21:22:55

sobereva 发表于 2021-6-27 20:25
正常情况默认就会利用所有CPU逻辑核心

如果你确信并非所有物理核心都被利用了，mdrun明确加上-ntmpi 44 ...

谢谢老师解答，刚才试了一下还是不行:( 我猜测是因为只能用一个节点所以另一个cpu就闲置了嘛，老师我是小白并行这些实在不懂

sobereva 发表于 Post on 2021-6-27 20:25:36

正常情况默认就会利用所有CPU逻辑核心

如果你确信并非所有物理核心都被利用了，mdrun明确加上-ntmpi 44 -pin on再试

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register