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求助包含Ni和Fe的金属配合物泛函选择

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发布时间: 2021-7-4 10:52

正文摘要:

在使用PBE0-GD3BJ/def2-SVP计算Ni/Fe双金属配合物中,发现5、7、9、11重态能量很相近(1 kcal以内),Ni-Fe键长在3埃左右。这是否说明此体系多参考态性质显著,选择TPSS或MN15-L等纯泛函更为合适?谢谢!

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zjxitcc 发表于 Post on 2021-7-20 16:36:18
本帖最后由 zjxitcc 于 2021-7-20 16:39 编辑
seenbefore 发表于 2021-7-20 16:26
谢谢几位老师。对比在def2-SVP和def2-SVP结合SDD的优化结果,发现自旋密度的分布、金属的价态等发生了显著 ...

赝势和全电子基组算出来波函数信息差异大很正常,这个本来也没什么标准答案,不是实验可测的。而且def2SVP基组也有点小了,好歹算个def2TZVP级别的单点。
seenbefore 发表于 Post on 2021-7-20 16:26:06
谢谢几位老师。对比在def2-SVP和def2-SVP结合SDD的优化结果,发现自旋密度的分布、金属的价态等发生了显著的变化,结构也有可观的改变,这种情况下应该采信什么?
sobereva 发表于 Post on 2021-7-13 14:06:58
seenbefore 发表于 2021-7-12 14:37
谢谢sob老师,由于def2系列对第四周期也是全电子,我在计算def2-TZVP单点的时候是否也要结合SDD赝势?会 ...

当然不需要
放心直接用def2-TZVP就完了
zjxitcc 发表于 Post on 2021-7-12 14:50:48
本帖最后由 zjxitcc 于 2021-7-12 14:52 编辑
seenbefore 发表于 2021-7-12 14:37
谢谢sob老师,由于def2系列对第四周期也是全电子,我在计算def2-TZVP单点的时候是否也要结合SDD赝势?会 ...

以下两种计算都是合理的:
(1)全用def2TZVP;
(2)3d金属用SDD,非金属用def2TZVP。
双核过渡金属在一个自旋多重度下一般有多个SCF解,甚至有多个SCF稳定解,直接盲目比较两种计算结果是危险的,至少要找到一个自旋多重度下所有可能的SCF稳定解之后 再行比较。解不稳定、解不同都会影响结构优化(当然,SCF解不稳定就开始结构优化 是十分不推荐的)。
seenbefore 发表于 Post on 2021-7-12 14:37:50
sobereva 发表于 2021-7-8 12:36
建议过渡金属优化时候用SDD或lanl2TZ(f)
TPSS-D3(BJ)优化没什么问题,用TPSSh-D3(BJ)大概率更好
单点能 ...

谢谢sob老师,由于def2系列对第四周期也是全电子,我在计算def2-TZVP单点的时候是否也要结合SDD赝势?会不会显得很奇怪?
目前发现单用def2-TZVP的结果,与给Fe和Ni上SDD,其他原子是def2-ZTVP的结果,有不小的差别,应该采信哪一个?
sobereva 发表于 Post on 2021-7-8 12:36:23
seenbefore 发表于 2021-7-7 10:47
sob老师,结构示意图在10楼,您对该体系优化和单点使用的泛函有什么建议?可以用TPSS-GD3BJ/def2-SV(P)优 ...

建议过渡金属优化时候用SDD或lanl2TZ(f)
TPSS-D3(BJ)优化没什么问题,用TPSSh-D3(BJ)大概率更好
单点能用什么级别看实际体系总大小。依然用TPSSh-D3(BJ)也可以
seenbefore 发表于 Post on 2021-7-7 15:09:44
wzkchem5 发表于 2021-7-7 14:51
两个金属的形式价态分别是多少?

因为是一系列氧化过程,所以价态有变化,Ni在+2到+3,Fe在+3到+5
wzkchem5 发表于 Post on 2021-7-7 14:51:31
seenbefore 发表于 2021-7-5 02:28
谢谢各位,核心结构是这样的,两个金属分别为五配位和六配位,体系原子数大约为90,在氧化中确实会发生酚氧 ...

两个金属的形式价态分别是多少?
seenbefore 发表于 Post on 2021-7-7 10:47:30
sobereva 发表于 2021-7-4 14:14
尽量把结构贴出来,要不然没法确切回答

sob老师,结构示意图在10楼,您对该体系优化和单点使用的泛函有什么建议?可以用TPSS-GD3BJ/def2-SV(P)优化,TPSS-GD3BJ/def2-TZVP算单点吗?或者用双杂化算单点?
wzkchem5 发表于 Post on 2021-7-4 20:58:15
renzhogn424 发表于 2021-7-4 13:10
学习一下,这个太高端了。
就是说这里DFT已经不能很好地描述了?只能优化一下结构,CASPT2才能可靠描述 ...

对,大概率是这样的
renzhogn424 发表于 Post on 2021-7-4 20:10:38
wzkchem5 发表于 2021-7-4 18:39
这个分子大吗?如果比较小的话,可以用CASPT2优化结构。如果CASPT2优化结构跑不动,那可以用DFT优化,再 ...

学习一下,这个太高端了。
就是说这里DFT已经不能很好地描述了?只能优化一下结构,CASPT2才能可靠描述?
wzkchem5 发表于 Post on 2021-7-4 18:39:29
renzhogn424 发表于 2021-7-4 10:19
这种情况应该怎么办?

这个分子大吗?如果比较小的话,可以用CASPT2优化结构。如果CASPT2优化结构跑不动,那可以用DFT优化,再用CASPT2或NEVPT2算单点(建议用NEVPT2,比较稳定),不过建议用这个NEVPT2结果作为benchmark,验证一下你选的泛函是不是合理。如果有自由基离域到配体上了,那么纯泛函未必更合适,因为还要考虑到self-interaction error的影响。
renzhogn424 发表于 Post on 2021-7-4 17:19:18
wzkchem5 发表于 2021-7-4 14:53
你这个是几价的Ni和Fe?11重态应该不是所有自旋都在金属上吧,不然意味着Ni是d5,也就是五价Ni,可能太高了 ...

这种情况应该怎么办?

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