Yyyw 发表于 2024-6-27 22:55 你好，请问一下这个vibrational analysis 的输入文件是啥啊？我这个框一直是灰色的，我实在超算计算的，是不是需要把.check文件下载到本地才行啊？ |
Yyyw 发表于 2024-6-27 22:55 你好，请问一下，vibrational analysis分析的输入文件是啥？我这个框框是灰色的，我是提交到超算计算的，是不是需要.check文件啊？ |
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Yyyw 发表于 2024-6-27 22:55 你好，请问一下，你这个Vibrational Analysis使用哪个模块算的啊？castep模块我没找到Vibrational Analysis呢 |
Yyyw 发表于 2024-6-28 12:35 没办法，反应方面MS CASTEP确实也就这样了，虽然可以用ase去调用，但门槛会有一些，不如直接去用QE或者VASP或者Abinit。 |
卡开发发 发表于 2024-6-28 12:24 图里就是取消之后重新calculate过的，hh。我看大部分硕博论文都用CASTEP算。感谢老师耐心解答我这个小白的每个问题，受益匪浅  感谢感谢 |
Yyyw 发表于 2024-6-28 12:06 取消之后重新在Analysis点击Calculate看看？两个虚频对CASTEP也没办法进一步精修过渡态，所以我说找过渡态其实用CASTEP很麻烦。 |
卡开发发 发表于 2024-6-28 11:57 感谢老师耐心解答，确实取消勾选了也没有  ，那这是另一个过渡态的声子谱，有两个虚频，如果在正确的情况下碰到两个虚频应该怎么处理（我这图大概率也都不是正确的 |
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Yyyw 发表于 2024-6-28 11:39 在Vibraitonal Analysis->Options->Calculation当中去除勾选Project out zero frequency modes试试。但大概率你的过渡态的虚频可能只是噪声引起的，这体系还是不太建议CASTEP做。 |
卡开发发 发表于 2024-6-28 11:20 好奇怪，我咋算完声子谱后vibrational analysis的框当中还是没有负的频率值，懵了 |
Yyyw 发表于 2024-6-28 10:48 你可以在上面那个vibrational analysis的框当中选中负的频率值（实际应当是虚频），看看那个animation是否能预览，如果可以得到xtd的轨迹，看看其箭头是否沿着反应路径。 |
卡开发发 发表于 2024-6-28 10:23 能再详细请教一下“虚频对应的振动模式按道理要沿着反应/迁移方向”这个应该怎么看呢，以及如果频率算出来有两个负数应该怎么办，感谢 |
Yyyw 发表于 2024-6-28 08:34 虚频对应的振动模式按道理要沿着你反应/迁移方向，不过这个虚频值也太小了，找过渡态CASTEP的短板比较严重。 |
卡开发发 发表于 2024-6-28 01:40 请问是算完声子谱里面的结果文件里面的这部分有个虚频就说明找对了是吗
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Yyyw 发表于 2024-6-27 22:55 你需要对过渡态结构进行与结构优化完全相同计算参数（包括计算精度和赝势还有理论方法）的声子谱，然后再做振动分析。 |
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