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径向分布函数（RDF）与对分布函数（PDF）的区别和联系？以及如何进行归一化？

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Alset

发布时间: 2021-7-16 10:27

正文摘要:

本帖最后由 Alset 于 2021-7-16 10:31 编辑老师们好，我借鉴《Computer Simulation of Liquid》中所介绍的如下代码思路，用python编写了代码进行了对分布函数的计算，但发现其无法进行归一化。 4、RDF与PDF ...

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txhbd 发表于 Post on 2025-7-29 11:20:56

牧生发表于 2024-6-4 20:14
没有什么后续啊，溶液体系是最终归趋于1，但是对于有固体的部分，就是超过1的，没有问题

您好，请问关于RDF趋势超过1，有相关文献说明吗？我在计算溶液体系的时候也出现RDF趋势超过1的现象，趋势和您提供的图片趋势类似，不知道是什么原因，想请教一下^^

s541040349 发表于 Post on 2025-3-31 22:56:06

楼主你好，请问对分布函数的计算您可以教一下吗

牧生 发表于 Post on 2024-6-4 20:14:16

MagicMa 发表于 2024-6-4 17:02
你好层主，请问这张图有后续嘛，我也遇到了相似的问题，对多糖进行6 ns的模拟时计算RDF能够收敛到1，但是 ...

没有什么后续啊，溶液体系是最终归趋于1，但是对于有固体的部分，就是超过1的，没有问题

MagicMa 发表于 Post on 2024-6-4 17:02:50

牧生发表于 2021-7-16 10:50
虽然不懂这个，但有个疑问，RDF是一定会收敛到1吗？？

比如我做均匀的溶液中，两个组分的两种原子，RDF ...

你好层主，请问这张图有后续嘛，我也遇到了相似的问题，对多糖进行6 ns的模拟时计算RDF能够收敛到1，但是延长模拟到100 ns时出现了相似的RDF曲线，有点不太知道如何去解释

有何不可琼 发表于 Post on 2021-9-21 17:10:05

请问楼主，你现在搞清楚 rmax. 值应该如何设置了没？跟晶胞的晶格参数有没有关系？

Alset 发表于 Post on 2021-9-3 09:40:25

十分抱歉，经过检查，应该是周期性边界条件中的单位出了问题。但是对于问题2、3、4，我还是没有得到清晰的答案

Alset 发表于 Post on 2021-7-16 20:14:17

牧生发表于 2021-7-16 10:50
虽然不懂这个，但有个疑问，RDF是一定会收敛到1吗？？

比如我做均匀的溶液中，两个组分的两种原子，RDF ...

RDF应该是不一定会收敛于1的，需要结合具体情况进行讨论。

牧生 发表于 Post on 2021-7-16 10:50:06

本帖最后由牧生于 2021-7-16 10:53 编辑

虽然不懂这个，但有个疑问，RDF是一定会收敛到1吗？？

比如我做均匀的溶液中，两个组分的两种原子，RDF最终会收敛到1，这个很容易理解。
但是，如果我做金属表面和某溶质的水溶液接触的模拟，想考察距离金属原子多远的地方，出现某种溶质的概率。以金属原子和溶质中某种原子计算RDF，这样就不会收敛到1，图形是这样的

请问，这样的图形有错误吗？？或者，这样的图形有意义吗？该怎样解释这样的图形呢。

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