mdrun做矿物-溶液-离子体系时遇到的一些问题

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发布时间: 2021-7-19 11:40

最近在做矿物-溶液-离子体系，分别做了能量最小化，npt，nvt，在npt和nvt时各遇到了两个不同问题，以下是我的文件（gro文件略大，没上传）：我在构建体系时，在矿物局部地方同时将两个-OH连接到一个Al原子上（ ...

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木林森 发表于 Post on 2021-7-20 16:13:24

sobereva 发表于 2021-7-19 22:55
2 可能是bond项没起作用，检查拓扑文件写错没有。谐振势如果生效的话绝对不可能跑那么远

谢谢sob老师，我仔细检查过itp文件，应该没啥问题，也不知道该怎么解决了

sobereva 发表于 Post on 2021-7-19 22:55:11

2 可能是bond项没起作用，检查拓扑文件写错没有。谐振势如果生效的话绝对不可能跑那么远

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