求助：拓扑文件构建不成功

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发布时间: 2021-7-28 15:06

本人通过MS导出得到.Pdb的文件如下：之后用Gromacs生成拓扑文件（pdb2gmx –ff opls-aa/l –f b.pdb –o lws.pdb –p lws.top）出现如下警告：见附件之后用通过在线ACPYPE网站生成，又出现 <| ACPYPE: AnteCham ...

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zaqxs234 发表于 Post on 2024-4-14 18:21:52

MOI_001 发表于 2024-1-26 00:25
请问你解决了吗？我也遇到了这个问题，只不过是在用acpype生成小分子拓扑文件时，可否分享一下你的解决方法 ...

那会还没有sobtop，acpype这个搞出来的拓扑文件也不太好，放弃了，我现在都是用的sobtop了

MOI_001 发表于 Post on 2024-1-26 00:25:01

请问你解决了吗？我也遇到了这个问题，只不过是在用acpype生成小分子拓扑文件时，可否分享一下你的解决方法呢？谢谢

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