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使用Multiwfn通过ETS-NOCV方法深入分析片段间的轨道相互作用

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发布时间: 2021-7-31 13:11

正文摘要:

使用Multiwfn通过ETS-NOCV方法深入分析片段间的轨道相互作用In-depth analysis of orbital interactions between fragments using the ETS-NOCV method in Multiwfn 文/Sobereva@北京科音  2021-Jul-31 ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-11-29 00:24:17
LZHX2210 发表于 2023-11-28 22:45
老师好,想请教一个问题。
看了您在本文中“3.4 弱相互相互作用的例子:A-T碱基对”这个研究分子间弱相互 ...

不存在“静电轨道相互作用”这种说法
静电作用和轨道相互作用完全是两种不同的本质

看下文了解弱相互作用本质方面的相关常识
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobereva.com/413http://bbs.keinsci.com/thread-9772-1-1.html
LZHX2210 发表于 Post on 2023-11-28 22:45:18
老师好,想请教一个问题。
看了您在本文中“3.4 弱相互相互作用的例子:A-T碱基对”这个研究分子间弱相互作用的例子。
以及您在http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html中提到
“值得一提的是,sobEDA/sobEDAw给出的轨道相互作用能ΔE_orb还可以用Multiwfn进一步通过ETS-NOCV方法进行分解,
能得到不同类型轨道相互作用的能量贡献以及对应的电子密度变化,对于探究片段间轨道相互作用本质极其有用!”

我想请教一下,分子间的这种弱相互作用的轨道类型是  “范德华轨道相互作用和静电轨道相互作用”   吗?
护卫天使 发表于 Post on 2022-11-9 16:08:08
护卫天使 发表于 2022-10-22 10:36
老师好,对于ETS-NOCV分析,片段自旋多重度比较麻烦。这是我计算的复合物和三个片段的设置,麻烦老师帮忙看 ...

老师好,对于这个体系,想先做个能量分解,再分析ETS-NOCV。老师博文中说到GAMESS-US软件最推荐,但是没有相关教程,输入文件相较麻烦。请问老师的EDA-FF方法是否适用?Multiwfn结合高斯作简单能量分解,但不能单独输出静电作用。
sobereva 发表于 Post on 2022-11-7 10:19:50
护卫天使 发表于 2022-11-7 10:00
好的感谢老师。
1、这么多负值的原因是单纯由基组引起的吗?
2、我对复合物的IRI和AIM分析还有计算结合 ...

1 可能是也可能不是
2 没有问题
护卫天使 发表于 Post on 2022-11-7 10:00:19

好的感谢老师。
1、这么多负值的原因是单纯由基组引起的吗?
2、我对复合物的IRI和AIM分析还有计算结合能,计算级别都是PBE0/def2-tzvp级别。不知道在CDA和ETS-NOCV分析,假如用了不同的基组,这样是否合适?希望得到老师的解答。
sobereva 发表于 Post on 2022-11-6 09:52:38
护卫天使 发表于 2022-11-5 15:11
再次向老师请教一下,我用34L文件的计算结果作了CDA分析,结果bcck donation这一项都是负数,这该如何解 ...

可以用6-31G*试试
护卫天使 发表于 Post on 2022-11-5 15:11:01
本帖最后由 护卫天使 于 2022-11-5 15:21 编辑

再次向老师请教一下,我用34L文件的计算结果作了CDA分析,结果bcck donation这一项都是负数,这该如何解释?是否CDA对该体系不适用?而且我在ETS-NOCV分析中明显看到了电子反馈的现象。

1667632303404.jpg (11.23 KB, 下载次数 Times of downloads: 82)

1667632303404.jpg
sobereva 发表于 Post on 2022-10-24 05:03:50
shiqiyuan 发表于 2022-10-23 09:33
老师,这种算法,如果使用激发态波函数的文件可以做相关的分析吗

只支持单行列式波函数
如果你是指KS-DFT算的激发态波函数可以,TDDFT之类不行
shiqiyuan 发表于 Post on 2022-10-23 09:33:29
老师,这种算法,如果使用激发态波函数的文件可以做相关的分析吗
sobereva 发表于 Post on 2022-10-23 04:24:10
护卫天使 发表于 2022-10-22 10:36
老师好,对于ETS-NOCV分析,片段自旋多重度比较麻烦。这是我计算的复合物和三个片段的设置,麻烦老师帮忙看 ...

可以
护卫天使 发表于 Post on 2022-10-22 10:36:36
本帖最后由 护卫天使 于 2022-10-22 10:38 编辑

老师好,对于ETS-NOCV分析,片段自旋多重度比较麻烦。这是我计算的复合物和三个片段的设置,麻烦老师帮忙看一下这样设置是否可行。

3.gjf

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1.gjf

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liangsirskku 发表于 Post on 2022-10-13 11:28:28

谢谢sob老师指出!
sobereva 发表于 Post on 2022-10-11 22:01:15
liangsirskku 发表于 2022-10-10 20:37
Sob老师你好,在教程中你提到14 Calculate composition of NOCV orbitals and pairs.但是我在菜单中并未发 ...

版本太老
liangsirskku 发表于 Post on 2022-10-10 20:37:17
Sob老师你好,在教程中你提到14 Calculate composition of NOCV orbitals and pairs.但是我在菜单中并未发现选项14,其他选项也挨着试了并没有文中提到的结果。请问这是笔误吗?

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