Dave666 发表于 2026-1-8 17:28 Multiwfn手册里ETS-NOCV部分给了原文,引用之 |
| 老师您好,请问使用Multiwfn+Gaussian进行ETS-NOCV分析的话,除了Multiwfn的两篇必引文献和Gaussian的引用外,对于ETS-NOCV,应该引用什么文献呢? |
谢谢sob老师的回复,多谢! 抱歉,忘记仔细研读Multiwfn手册2.9.2.2节中周期功能介绍的了。 期待以后可以。 |
smiling123 发表于 2025-11-27 20:52 目前不支持周期性体系 Multiwfn目前什么功能支持周期性在手册2.9.2.2节写明了 |
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本帖最后由 smiling123 于 2025-11-27 21:07 编辑 sob老师您好,请问可以以ETS-NOCV方法计算周期性边界条件下两片段之间的轨道相互作用能吗?审稿人要求计算,头大 。我以gaussian试着优化了周期性边界条件下的晶体结构,再计算了两个碎片的单点能,再运行Multiwfn,按流程以ETS-NOCV方法计算pair energy,试试了好几次, 总是报错:Input path of wavefunction file of fragment For example, D:\ll\A-Rise.mwfn fragment1.fchk Input path of wavefunction file of fragment 2 For example, D:\ll\A-Rise.mwfn fragment2.fchk Loading wavefunction information from fragment1.fchk Loading wavefunction information from fragment2.fchk Alpha and beta electrons of all fragments: 181 181 Reloading complex.fchk Calculating overlap integral matrix between fragment orbitals ... Intel MKL ERROR: Parameter 10 was incorrect on entry to DGEMM . Lowdin orthogonalization between occupied fragment orbitals ... Generating frozen state density matrix (P_frz) ... forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred Image PC Routine Line Source Multiwfn 00000000020E85F3 Unknown Unknown Unknown libpthread-2.17.s 00002B7F89426630 Unknown Unknown Unknown Multiwfn 00000000005A0AE0 Unknown Unknown Unknown Multiwfn 0000000000C3E146 Unknown Unknown Unknown Multiwfn 000000000085AD7B Unknown Unknown Unknown Multiwfn 0000000000431822 Unknown Unknown Unknown libc-2.17.so 00002B7F89655555 __libc_start_main Unknown Unknown Multiwfn 0000000000431729 Unknown Unknown Unknown 已经用了最小的基组和最小K点取样了,还是报错,报错内容同上。 但如果用这台机器的Multiwfn程序以ETS-NOCV方法计算非周期性结构两片段的轨道相互作用能,或者测试 Multiwfn程序自带的ETS-NOCV,都成功运行. 不知道哪里出了问题? |
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谢谢老师! |
f195 发表于 2025-11-23 19:53 可以 |
sobereva 发表于 2025-11-11 00:30 sob老师您好,请问我用ETS-NOCV得出的Sum of pair energies是sobEDA得出的E_orb的两倍以上,是否可以将其校正到E_orb来分析? |
Dave666 发表于 2025-11-13 23:06 “准分子轨道”语义不明 如果是指片段的分子轨道,我有空时倒是可以考虑加入NOCV orbital向片段轨道投影的功能。目前版本无法给出 |
| 参与人数Participants 1 | eV +1 | 收起 理由Reason |
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| + 1 | 谢谢sob老师,期待新功能 |
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老师您好,在文献中,我看到有些做EDA-NOCV分析的,会把NOCV pair分解成两个片段上的轨道来表示,并且标上HOMO,LUMO等。 比如这篇文章(Nat. Chem. 13, 89–93 (2021),doi:10.1038/s41557-020-00579-w)的图片
您的帖文中,我看到的功能是指出NOCV pair分解成壳层,另外还可以显示片段的准分子轨道。 请问ETS-NOCV是否有和图中类似的功能,能分辨某一NOCV pair是来源于哪个准分子轨道吗? |
Dave666 发表于 2025-11-11 02:39 基本可以,但更建议直接用sobEDA给出的E_orb项说事 |
本帖最后由 Dave666 于 2025-11-11 03:33 编辑 sobereva 发表于 2025-11-11 00:30 谢谢sob老师。 那如果我对同一分子的两个片段,按两种情况(Singlet+Singlet或Triplet+Triplet),只进行ETS-NOCV分析后,比较两种情况下输出的Sum of pair energies的绝对值。 我是否可以在文章中通过两者的比较,说明绝对值更小的那种情况所对应的成键方式是更准确的? 另外,对于Sum of pair energies,在文章中我是否可以直接用ΔE_orb表示?(虽然您本文中有指出,Sum of pair energies是总轨道相互作用能的近似值) |
Dave666 发表于 2025-11-10 22:57 1 哪种片段定义方式ΔE_orb越小,暗示哪种片段状态越接近整个体系中其实际状态、在形成实际成键方式时越不需要片段轨道相对于参考态发生变形 2 sobEDA结合ETS-NOCV分析 = EDA-NOCV 仔细看 谈谈分子间结合能的构成以及分解分析思想 http://sobereva.com/733(http://bbs.keinsci.com/thread-50890-1-1.html) 使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析 http://sobereva.com/685(http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html) 有什么审稿人不接受的理由?Multiwfn是用户最多的、最流行的波函数分析程序,知名度极高,到现在都被引用了超过37000次,海量用户都使用了Multiwfn做ETS-NOCV分析 ADF那个功能诞生的早所以现存文献里才见得多 |
| 参与人数Participants 2 | eV +4 | 收起 理由Reason |
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| + 1 | 谢谢 |
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本帖最后由 Dave666 于 2025-11-10 23:01 编辑 sob老师您好,在我所在的方向中,其他课题组为了分析某两原子成键是donor-acceptor或electron-share,会把这个键切开得到两个片段,然后比较在singlet+singlet和triplet+triplet两种情况下的ΔE_orb,他们认为这个能量越小,越代表这种情况是能更好地描述成键情况的。 比如如果singlet+singlet的ΔE_orb较小,那么则偏向认为是donor-acceptor;反之,如果triplet+triplet的较小,那么认为是electron-share 我搞不太懂为什么ΔE_orb越小越认为是合适的,希望老师能点拨下。 另外,在我所在的方向中,比较多使用的是ADF软件进行的EDA-NOCV分析。想问问这和老师您文中介绍的Multiwfn作的ETS-NOCV有什么区别吗?Multiwfn的ETS-NOCV是否也能用ΔE_orb和同样的原理来判断成键类型,会被审稿人接受吗? |
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