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求助 QMMM跑动力学过程报错QM区域原子与MM区域原子距离太近

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elpa

发布时间: 2021-8-14 22:59

正文摘要:

本帖最后由 elpa 于 2021-8-15 09:05 编辑 cp2k 用QMMM跑动力学，QM区域中心是两个金属离子，周围是60个水分子，MM区域都是水分子。跑到200步时报错提示两个粒子距离太近，查看结构发现是qm区域反应产生的一个质 ...

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elpa 发表于 Post on 2021-8-16 10:51:45

我把QMMM部分FORCEFIELD 里H的LJ参数随意增大很多就不报错了。但是不合理。

elpa 发表于 Post on 2021-8-15 08:46:29

sobereva 发表于 2021-8-14 23:48
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员 ...

好的老师

sobereva 发表于 Post on 2021-8-14 23:48:21

elpa 发表于 2021-8-14 23:07
这是我输入文件里QMMM部分

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员必读贴里明确说了

elpa 发表于 Post on 2021-8-14 23:07:06

本帖最后由 elpa 于 2021-8-15 08:47 编辑

elpa 发表于 2021-8-14 23:06
CELL ABC 39 39 39
QM CELL A 15.4 B 13 C 17.4
&QMMM

elpa 发表于 Post on 2021-8-14 23:06:16

CELL ABC 39 39 39
QM CELL  A  15.4  B  13  C  17.4
&QMMM
CENTER EVERY_STEP
CENTER_TYPE PBC_AWARE_MAX_MINUS_MIN
ECOUPL GAUSS
USE_GEEP_LIB 10
NOCOMPATIBILITY TRUE

&WALLS
   TYPE       REFLECTIVE
   WALL_SKIN 0.5 0.5 0.5
&END

&FORCEFIELD
.......
   &LENNARD-JONES
      atoms H H
      EPSILON [kcalmol]  0.046
      SIGMA [angstrom] 0.400
      RCUT [angstrom] 6
      &END LENNARD-JONES
......
&END FORCEFIELD

&END QMMM

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