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如何利用g09的counterpoise=2计算溶质与溶剂的结合能？

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maipi

发布时间: 2021-8-17 11:37

正文摘要:

本帖最后由 maipi 于 2021-8-17 11:36 编辑最近看到一篇文献利用高斯进行（1：1）溶质与溶剂的结合能计算，文献计算结果如图1所示，pdf见附件。由于本人之前没有接触过Gaussian09，也没有量化基础，遂有几个问题 ...

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maipi 发表于 Post on 2022-4-18 22:15:22

耳东宝99 发表于 2022-3-24 22:04
兄弟，你学会了吗？能否交流下

还在摸索中

耳东宝99 发表于 Post on 2022-3-24 22:04:27

maipi 发表于 2021-8-17 22:52
好的谢谢老师

兄弟，你学会了吗？能否交流下

maipi 发表于 Post on 2021-8-17 22:52:57

sobereva 发表于 2021-8-17 20:33
根据静电势判断溶剂分子放什么位置不是十分稳妥的做法。一方面这不考虑极化作用，另一方面这忽视了色散作用 ...

好的谢谢老师

sobereva 发表于 Post on 2021-8-17 20:33:54

根据静电势判断溶剂分子放什么位置不是十分稳妥的做法。一方面这不考虑极化作用，另一方面这忽视了色散作用。特别是像甲苯、氯仿这种低极性分子，色散作用对结合方式影响巨大。最靠谱也是最佳的做法是用genmer+molclus做溶质+溶剂的二聚体构型搜索，仔细看
genmer：生成团簇初始构型结合molclus做团簇结构搜索的超便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html
Molclus主页：http://www.keinsci.com/research/molclus.html

另外，如果你是要考察溶剂环境下的结合强度，而非真空下的结合强度，应当带溶剂模型，这对结合能影响甚巨。注意counterpoise计算时不能直接带着溶剂模型，此文说了
谈谈BSSE校正与Gaussian对它的处理
http://sobereva.com/46

尽量别用那么早期的G09版本，bug巨多

当前用的计算级别太烂，发文章没什么希望

maipi 发表于 Post on 2021-8-17 15:25:52

snljty 发表于 2021-8-17 15:16
这个计算结合能的级别太低，完全不能接受。可以看看卢老师博文
《谈谈BSSE校正与Gaussian对它的处理》
ht ...

好的谢谢你。除了方法和基组的问题外，我这样的计算流程有什么问题吗？

snljty 发表于 Post on 2021-8-17 15:16:37

这个计算结合能的级别太低，完全不能接受。可以看看卢老师博文
《谈谈BSSE校正与Gaussian对它的处理》
http://sobereva.com/46
《在ORCA中做counterpoise校正并计算分子间结合能的例子》
http://sobereva.com/542
《谈谈量子化学中基组的选择》
http://sobereva.com/336
泛函选择的也很奇怪。
看
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272

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