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metad收敛问题求助

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发布时间: 2021-8-19 21:12

正文摘要:

请教各位前辈,我常数自己做了一个metad一个金属配合物在水中的运动,CV设为金属的z坐标。运行失败显示格外访问后加了上下墙。plumed.dat文件: MOLINFO STRUCTURE=npt.pdb #position of Ni p: POSITION ATOM=1 ...

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Daniel_Arndt 发表于 Post on 2021-8-20 02:25:58
我没有检验收敛的经验,但有一个问题,我觉得你没有说清。在时间为700左右的时候,你关心的collective variable发生了突变,你有没有可视化相应时间段内的轨线,看看到底发生了什么?

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