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orca B97-3c优化300原子高分子SCF error termination报错

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发布时间: 2021-8-21 00:30

正文摘要:

本人试图用ORCA优化一个共轭高分子Poly(quinoxaline-2,3-diyl)。方法B97-3c。(最终目标是算通过计算不同聚合度下的HOMO-LUMO band,外推到聚合度100)。第一次尝试了聚合度为5,正常。再尝试聚合度为8,正常。聚合 ...

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sobereva 发表于 Post on 2021-8-22 03:17:38
liangsirskku 发表于 2021-8-22 03:09
折腾了下午,在WSL上装好了orca。验证性的运行同样的inp文件,运行正常。windows orca奇怪崩溃,WS ...

正常情况下,那样大小的体系做普通泛函的计算吃不了多少内存,所以只能认为是windows版自身的问题
可能和当前你的运行环境有关系,没细节不好说。也可能开发者在windows下基于MSMPI的测试不如linux下基于OpenMPI的测试充分,有些内存分配问题没发现。一般来说大型计算很少用windows版来做。
liangsirskku 发表于 Post on 2021-8-22 03:09:36
本帖最后由 liangsirskku 于 2021-8-22 03:25 编辑
sobereva 发表于 2021-8-21 13:59
可以找个linux机子试试

折腾了下午,在WSL上装好了orca。验证性的运行同样的inp文件,运行正常。windows orca奇怪崩溃,WSL上正常,请问社长这可能是什么原因呢?另外,在WSL上安装orca-5.0.1按照社长的教程并无问题
主要是openmpi-4.1.1安装容易出问题:Ubuntu20.4上用sudo apt install automake1.15而实际上安装的是automake1.15.1.这将导致无法正常安装openmpi.
如在官网上下载了automake-1.15,模仿http://bbs.keinsci.com/thread-16293-1-1.html文中的方法解压,安装也会出现一些奇怪的问题。
而使用 wget http://ftp.gnu.or。。。。再安装便无异常。(https://blog.51cto.com/u_12877374/2866838)
另外,安好了automake应关闭Ubuntu,再进入,再安装openmpi,否者也会出现奇怪报错。
paramecium86 发表于 Post on 2021-8-21 14:10:56
我试了试在虚拟机上跑了跑和楼主一模一样的输入文件, 是可以正常计算的。最大的内存大概占用到26GB左右。没有报错。
sobereva 发表于 Post on 2021-8-21 13:59:48
可以找个linux机子试试
wzkchem5 发表于 Post on 2021-8-21 02:18:52
内存不足。这个体系太大了,如果一定要跑,可以加大maxcore,如果你的机子没那么大内存,可以降低并行核数,这样就可以把maxcore加得更大。
但是聚合物的HOMO-LUMO gap基本上用200个原子以内外推就可以得到非常好的线性。你可以把1~8都算一遍,如果1~8的线性非常好,那就用这些外推就行了。再者,实验不管用什么方法测出的带隙,和计算的能级差都只是近似对应关系,计算的HOMO-LUMO gap并不严格对应任何实验可观测量(见http://sobereva.com/543),所以本来这个外推也不需要做得很准,因为外推误差一般远小于HOMO-LUMO gap与实验带隙的差别。

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